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前兩天差評君在網(wǎng)上沖浪的時候,看到了一條堪比當(dāng)年克隆羊多莉的大新聞。
明尼蘇達(dá)大學(xué)的 Kate Adamala 團(tuán)隊宣布,他們成功構(gòu)建了全球首個能完成“完整生命周期”的合成細(xì)胞。
這個被稱為“SpudCell(土豆細(xì)胞)”的玩意兒,居然能在培養(yǎng)皿里自己吃飯、長大、復(fù)制基因,還能分裂生娃,甚至還會跟同類搞職場內(nèi)卷。
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這玩意兒聽起來有點玄幻了嗷,消息一出,各路媒體紛紛高潮,學(xué)術(shù)界甚至有人將這比作生物學(xué)領(lǐng)域的“萊特兄弟首飛時刻”,仿佛人類馬上就要在實驗室里批量扮演上帝造物了。
所以咱們也去看了下,這個純?nèi)斯な执甑暮铣杉?xì)胞到底咋回事。
這個土豆細(xì)胞(以下簡稱土豆小子)顧名思義,在顯微鏡底下看起來坑坑洼洼的,長得就像個洋芋。
同時,這名字也致敬了第一顆人造衛(wèi)星“Sputnik”,研究團(tuán)隊希望能由此開啟生物學(xué)工程的新紀(jì)元;還有一點就是首席研究員Kate調(diào)侃自己的波蘭血統(tǒng)(因為土豆對波蘭人來說相當(dāng)于大米飯,所以在歐洲,土豆相當(dāng)于是波蘭人的外號)。
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土豆小子本質(zhì)上呢,還真算不上是真正的活體生命。
它總共只有9萬個的堿基對,要知道人類足足有30億個,就連大腸桿菌都有460萬個。
而這9萬個堿基對編碼了36個基因,它們沒合成成一個完整的DNA,而是像零件一樣分散在7個DNA分子里,所以每次復(fù)制繁殖的時候,難免會掉裝備。
所以土豆小子的生命力也非常虛,在實驗里,經(jīng)歷 5 代分裂后,僅有約 30% 的存活細(xì)胞還仍僥幸攜帶有完整的基因組。
不僅如此,由于土豆小子體內(nèi)的基因?qū)嵲谔倭耍B生物最基本的核糖體(細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)合成工廠)都造不出來,所以它壓根就不能搞定吃喝拉撒。
為了它能活著,科學(xué)家們還給它配了個外賣小哥,一種直徑約 0.4 微米的飼喂脂質(zhì)體,里面裝了營養(yǎng)物質(zhì)、核糖體和ATP,當(dāng)土豆小子外殼和秒送小哥接觸到,就意味著送餐已完成。
補水啦
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土豆小子吃飽后,內(nèi)部的 Phi29 聚合酶開始瘋狂工作,通過滾環(huán)擴(kuò)增,就會把那 7 個質(zhì)粒的基因組全給復(fù)制一遍。
這么廢廢的土豆小子在繁殖的時候,也有點力不從心。
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科學(xué)家們?yōu)榱吮WC繁殖的成功率,采用了簡單粗暴的機械擠壓法,通過濾膜狠狠地擠壓土豆小子,幫它強行完成復(fù)制分裂。
更有意思的是,研究團(tuán)隊還給土豆小子安排了一場饑餓游戲。
他們做了兩批細(xì)胞:一批普通版,一批裝了大胃袋的MAX版本,優(yōu)勢就是能更好地取外賣。
結(jié)果發(fā)現(xiàn),更強配置確實換來了更好的生態(tài)位,通過五代繁衍,MAX版本能從原本的 50% 比例漲到 61%;如果一開始只占 10%,五代后也能漲到 38%。
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而且,如果提供的食物越少,這個優(yōu)勢越明顯,在最缺飯的實驗里,也就是外賣小哥的濃度只有正常水平的十分之一,MAX版本幾乎壟斷了稀缺資源,五代之后,數(shù)量占比飆到 70%。
雖然土豆小子看起來很糙,但它的思路才是學(xué)術(shù)界驚嘆的根本原因。
在土豆小子之前,科學(xué)家們搞合成細(xì)胞,走的基本是“自上而下”的路線。
簡單來說,就是玩疊疊樂,通過把現(xiàn)有的細(xì)胞、細(xì)菌里面的基因,一點點摳掉,以此研究哪些基因才是生命必備的,然后針對性研究就完事了。
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當(dāng)年合成生物學(xué)大佬克雷格·文特爾,拿了一個活生生的絲狀支原體細(xì)菌,一直摳到 2016 年,搞出了當(dāng)時已知具有最小基因組的細(xì)胞,只有 473 個基因。
聽起來是不是很靠譜,但老天爺開了個致命的玩笑,溫特爾大哥都整到只有473個基因了,結(jié)果里面有149個還是搞不清楚是干嘛的。。。
這就像你拿到了一個經(jīng)過無數(shù)次迭代、勉強能跑的祖?zhèn)魇荷酱a,雖然你把它精簡了,但里面依然有一堆你不知道干啥的黑箱邏輯,一碰就可能崩潰。
而土豆小子直接反向操作,走的是極為頭鐵的“自下而上”路線,也就是不拿現(xiàn)成的活物魔改了,咱們直接用純化學(xué)物質(zhì)堆積木。
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研究團(tuán)隊直接用非生命的純化酶、合成脂質(zhì),加上一套被稱為 PURE 的游離翻譯系統(tǒng),從零開始搭建。
這意味著這個系統(tǒng)是 100% 透明的,科學(xué)家對里面的每一個成分、每一個濃度都門兒清。從依賴自然盲盒的發(fā)現(xiàn)科學(xué),到完全可控的工程設(shè)計,這才是它最恐怖的地方。
不過也正是這種違反祖宗家法的操作,讓土豆小子有點不受待見。
之前研究團(tuán)隊滿懷信心地把論文投給了頂刊《Cell》,結(jié)果被拒稿了,一個審稿人直接說,土豆小子根本就不是真正的生物學(xué)(確實,更像土木老哥的工程學(xué)是吧)。
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如今,這篇論文已經(jīng)上傳到了 bioRxiv 上的預(yù)印本,還需要通過正式的同行評審才算正式發(fā)表。
但首席研究員 Kate Adamala 在把手稿上傳之前,竟然先把論文提前群發(fā)給了各大科技媒體的記者。
這種“先找媒體造勢,再走同行評審”的騷操作,也給不少專業(yè)人士留下了不好的印象。
既然不是真正的活體生命,也不夠完美,那土豆小子到底有什么用?
這主要還是因為現(xiàn)階段的地球生物,基本人人擁有自己的祖?zhèn)魇荷酱a,每次遇到問題,科學(xué)家們想從根上、直接動用基因編輯技術(shù)去調(diào)整些什么,總會引發(fā)一些預(yù)期外的問題,或者引來公眾的非議。
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而土豆小子的出現(xiàn),其實就是人類開始從基本化學(xué)物質(zhì),自己一點點焊出來的第一個純血系統(tǒng)。
它的功能確實簡陋到令人發(fā)指,但它的每一行底層架構(gòu)、每一成分的濃度對我們來說都是已知的,那如果以此為起點,反向編譯細(xì)胞、生命,那人類真就可能成為了掌控萬物的造物主了。
而更現(xiàn)實的是,土豆小子的研究團(tuán)隊已經(jīng)開始動手了,他們和斯坦福的學(xué)者聯(lián)手,創(chuàng)立了一個名為 Biotic 的公益性機構(gòu),并拿到了約一千萬美元級別的種子資金。
他們的終極目的,是效仿當(dāng)年的 Linux 操作系統(tǒng),把這套生物底層平臺徹底開源化。
難道說21世紀(jì)真的是生物的世紀(jì)?
說這個確實早了點,咱們還是先祝這顆土豆早日挺過同行評審的毒打,順順利利發(fā)個頂刊吧。
撰文:八戒
編輯:江江 & 面線
美編:素描
圖片、資料來源:
Science:Lab-created ‘SpudCell’ marks ‘stunning’ step toward building life from scratch
The NewYork Times:Scientists Made a Cell With Most of the Hallmarks of Life. Here’s What to Know.
A Chemically Defined Synthetic Cell Capable Of Growth And Replication
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