聚焦腸道噬菌體！中山六院左濤課題組Cell Host & Microbe兩連發(fā)

腸道里住著一種叫“噬菌體”的病毒，它是腸道病毒群中的重要成員，在人體健康和疾病中扮演了目前尚未被深入解析的功效。近日，我院左濤研究員團隊在腸道噬菌體/病毒組領(lǐng)域取得重要進展，兩篇相關(guān)文章先后發(fā)表在Cell子刊Cell Host & Microbe（IF:18.7）。一篇闡釋了腸道噬菌體在炎癥性腸病（IBD）中的作用機制，另一篇揭示了抗病毒藥物對人體共生病毒組（包括噬菌體）的潛在影響。這些發(fā)現(xiàn)為理解腸道噬菌體/病毒組與宿主健康的關(guān)系提供了全新視角。

噬菌體“腸型”決定克羅恩病炎癥異質(zhì)性

2026年3月，左濤團隊于Cell Host & Microbe發(fā)表研究論文“Gut DNA virome enterotype dictates inflammation heterogeneity through tuning the phage-bacteria-sphingosine-intestine axis in Crohn’s disease并被Cell HostMicrobe選為亮點文章（Featured Article），同時有專家同期述評 (Preview)。該研究聚焦一個長期被忽視的核心問題：腸道噬菌體如何影響IBD腸炎異質(zhì)性？

克羅恩病（Crohn's disease, CD）是一種常見的炎癥性腸病（IBD）。其發(fā)病涉及遺傳因素、環(huán)境影響和腸道微生物失調(diào)等多重因素。以往研究多聚焦于腸道細菌的作用，卻忽略了數(shù)量遠超細菌的噬菌體。噬菌體作為專門感染細菌的病毒，堪稱腸道生態(tài)系統(tǒng)的“調(diào)節(jié)大師”。它們?nèi)绾斡绊懣肆_恩病的炎癥差異以及背后的機制，仍是醫(yī)學領(lǐng)域的未解之謎。

研究團隊收集了克羅恩病患者和健康人的腸道黏膜和糞便樣本，進行噬菌體測序、基因和代謝物分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，人類噬菌體群可分為兩種截然不同的“腸型”：E1型與E2型。其中E2型相關(guān)噬菌體Wulfhauvirus在克羅恩病患者中顯著富集，提示其可能與腸道炎癥加重相關(guān)。進一步的研究表明，E2型噬菌體群相比E1型具有更強的促炎作用。機制上，E2中分離得到的新型溫和性噬菌體?BTZT001P（屬于Wulfhauvirus）通過溶原方式感染多形擬桿菌（Bacteroides thetaiotaomicron），增強其鞘氨醇（sphingosine）合成分泌，進而抑制共生菌Blautia obeum的生長，導致腸道菌群失衡并加劇腸道炎癥。該研究揭示了腸道噬菌體群組成差異可通過“噬菌體-細菌-代謝物-腸道”軸影響克羅恩病結(jié)局，強調(diào)了腸道噬菌體與細菌之間的“跨界互動”在維持腸道穩(wěn)態(tài)及克羅恩病發(fā)生發(fā)展中的重要作用。

專家同期述評 (Preview)

抗病毒藥物治療的另一面

——它會“誤傷”我們的共生病毒嗎？

繼左濤被Nature Reviews MicrobiologyNature Reviews Gastroenterology & Hepaotology （*2）、Lancet Gastroenterology & Hepatology邀稿撰寫腸道病毒組文章后，今年5月，他再次受邀于Cell Host & Microbe發(fā)表文章“Potential impacts of antivirals on the virome”，聚焦一個長期被忽視的核心問題：抗病毒藥物是否會對人體內(nèi)共存的共生病毒產(chǎn)生影響？

抗病毒藥物是全球應用最廣泛的抗感染手段之一，對治療流感、肝炎、HIV等疾病至關(guān)重要。然而，這類藥物在攻擊病原病毒的同時，是否會影響人體內(nèi)那些共存的“無害病毒”？人體內(nèi)的共生病毒組通過與免疫系統(tǒng)、細菌群落的互動，參與維持健康穩(wěn)態(tài)。遺憾的是，抗病毒治療對這一生態(tài)系統(tǒng)的潛在影響長期被忽視。針對這一問題，本文首次系統(tǒng)闡述，填補了該領(lǐng)域的概念空白。

抗病毒藥物可能通過兩種方式重塑共生病毒組。一是直接作用：不同病毒在結(jié)構(gòu)上存在相似性，藥物可能對非靶向的共生病毒產(chǎn)生交叉反應。二是間接作用：藥物通過調(diào)控宿主免疫或重塑細菌群落，引發(fā)“級聯(lián)反應”，間接改變病毒組的組成與活性。論文首次構(gòu)建了“抗病毒藥物—共生病毒組”雙向互作的理論框架，超越傳統(tǒng)僅關(guān)注靶病毒的視角，揭示了病毒組從“被動背景”向“主動調(diào)節(jié)因子”的角色轉(zhuǎn)變。

當前，抗病毒藥物如何影響共生病毒組的研究仍處于起步階段，現(xiàn)有證據(jù)多為相關(guān)性探索，缺乏系統(tǒng)性的因果解析。未來亟需開展機制導向的系統(tǒng)性研究，以解析二者之間的復雜互動關(guān)系。左濤團隊為這一新興方向提供了系統(tǒng)化的概念基礎(chǔ)與理論起點，有望推動抗病毒策略從“單一殺滅”向“生態(tài)調(diào)控”的范式轉(zhuǎn)變，為更精準的抗病毒治療和微生態(tài)穩(wěn)態(tài)管理開辟新路。

左濤團隊合照

專家介紹

左濤研究員

國家高層次青年人才，中山大學胃腸病學研究所副所長，中山大學人體微生態(tài)與慢病教育部重點實驗室常務(wù)副主任，中山大學“百人計劃”中青年杰出人才。WHO藥物對腸道微生態(tài)健康工作組專家（全球6位），入選全球前2%頂尖科學家，獲得美國消化病學會(AGA)頒發(fā)的“青年研究獎”（連續(xù)2次）、Elsevier中國高被引學者、世界微生物科普倡議組 (IMiLI) 成員、香港中文大學研究計劃fellowship、歐洲克羅恩病與結(jié)腸炎委員會（ECCO）青年委員、國際微生物病毒協(xié)會（ISVM）會員、美國微生物學會（ASM）會員、中國微生物學會微生態(tài)專委會委員、中國生物物理學會腸道菌群分會委員、中國微生物學會益生菌專委會委員、中國人體健康科技促進會腸道微生態(tài)與菌群移植專業(yè)委員會常務(wù)委員、中國醫(yī)藥教育協(xié)會微生態(tài)與健康專業(yè)委員會委員、廣東省精準醫(yī)學應用學會微生態(tài)醫(yī)學分會委員、廣東省精準醫(yī)學應用學會長青智庫工作委員會委員。以最后通訊作者發(fā)表Cell Host & Microbe (3)、Cell Metabolism(1)、Nature Metabolism (2)、Lancet Gastroenterology & Hepatology (1)、Lancet Microbe(2)、Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology (2)、Nature Reviews Microbiology (1)、Nature Reviews Bioengineering (1)、Gut (2)、Microbiome (1)、Nature Communications (1)、Gut Microbes (1)、Journal of Medical Virology (1)等。

責任編輯：劉山青

初審：張源泉

審核：樂虞瑩、呂竹

終審：李文敏

審定發(fā)布：龍波