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2026年5月,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海市第一人民醫(yī)院范能廣、彭永德、劉芳團(tuán)隊(duì),聯(lián)合上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬龍華醫(yī)院、上海市松江區(qū)中心醫(yī)院、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬上海市第一人民醫(yī)院臨床藥學(xué)科、消化內(nèi)科、肝膽外科及臨床研究中心等單位,在Metabolism(中科院醫(yī)學(xué)1區(qū),2024 Impact Factor=11.9)在線發(fā)表題為 “KCMF1 promotes MASLD progression via K48-linked ubiquitination and degradation of AMPKα” 的研究論文。該文于2025年12月7日投稿,2026年5月17日接收。
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代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝病(MASLD)目前仍缺乏有效藥物治療。AMP活化蛋白激酶(AMPK)是維持肝臟能量代謝穩(wěn)態(tài)的重要分子,在促進(jìn)脂肪酸氧化、抑制脂質(zhì)生成和減輕肝臟代謝損傷方面具有關(guān)鍵作用。然而,在MASLD中,AMPK蛋白水平和活性下降的上游調(diào)控機(jī)制尚未完全明確。
本研究通過整合MASLD差異蛋白質(zhì)組學(xué)與AMPKα互作組分析,發(fā)現(xiàn)鉀通道調(diào)節(jié)因子1(KCMF1)是在MASLD肝臟中顯著上調(diào)、并可與AMPKα相互作用的E3泛素連接酶。進(jìn)一步機(jī)制研究顯示,KCMF1可直接結(jié)合AMPKα,促進(jìn)其發(fā)生K48連接的多聚泛素化,從而加速AMPKα降解并抑制肝臟AMPK信號通路。
在多種動物模型和原代肝細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中,肝臟KCMF1過表達(dá)可加重脂肪變性、炎癥和纖維化;相反,KCMF1敲低或肝細(xì)胞特異性敲除可改善HFD、GAN、CDAHFD及ob/ob等MASLD/MASH模型中的代謝紊亂和肝臟病理損傷。藥理學(xué)干預(yù)進(jìn)一步證明,KCMF1的促病作用依賴AMPK信號抑制:AMPK激活可減輕KCMF1誘導(dǎo)的病理改變,而AMPK抑制則削弱KCMF1缺失帶來的保護(hù)作用。
值得關(guān)注的是,研究團(tuán)隊(duì)還結(jié)合AI引導(dǎo)的虛擬篩選和生物物理學(xué)驗(yàn)證,鑒定出黃酮類化合物 rhoifolin 可直接結(jié)合KCMF1,穩(wěn)定AMPKα并恢復(fù)AMPK信號,從而在小鼠MASH模型中改善肝臟脂質(zhì)積累、炎癥浸潤和纖維化。該研究揭示了 KCMF1–AMPK軸 是MASLD進(jìn)展中新的翻譯后調(diào)控機(jī)制,也提示靶向KCMF1可能為MASLD/MASH治療提供新的干預(yù)方向。
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【摘要】
研究背景與目的:代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝病(MASLD)目前仍缺乏有效的藥物治療方案。AMP活化蛋白激酶(AMPK)是重要的代謝調(diào)控因子,具有肝臟保護(hù)作用,但在MASLD中,調(diào)控AMPK降解的上游機(jī)制仍不清楚。本研究鑒定出鉀通道調(diào)節(jié)因子1(KCMF1)是一種此前未被認(rèn)識到的、可靶向AMPKα的E3泛素連接酶,并進(jìn)一步探討其在MASLD發(fā)病過程中的作用。
研究方法:研究通過共免疫沉淀和GST pull-down實(shí)驗(yàn)分析蛋白相互作用;通過生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)評估泛素連接類型特異性以及AMPKα穩(wěn)定性;在多種小鼠MASLD模型中,包括高脂飲食(HFD)、Gubra-Amylin NASH飲食(GAN)、膽堿缺乏L-氨基酸定義高脂飲食(CDAHFD)以及ob/ob模型,評估肝細(xì)胞靶向的功能獲得實(shí)驗(yàn)和肝細(xì)胞特異性KCMF1缺失的影響;同時(shí)通過藥理學(xué)調(diào)控驗(yàn)證其對AMPK通路的依賴性。研究還結(jié)合AI引導(dǎo)的虛擬篩選和生物物理學(xué)驗(yàn)證,尋找候選KCMF1抑制劑。
研究結(jié)果:在小鼠和人MASLD肝臟的肝細(xì)胞中,KCMF1表達(dá)明顯上調(diào)。KCMF1能夠直接與AMPKα相互作用,并催化其K48連接的多聚泛素化,從而促進(jìn)AMPKα降解并抑制肝臟AMPK信號通路。從功能上看,肝臟KCMF1過表達(dá)會加重脂肪變性、炎癥和纖維化;相反,KCMF1敲低或肝細(xì)胞特異性刪除可在多種MASLD模型中發(fā)揮保護(hù)作用。在體內(nèi)和原代肝細(xì)胞中進(jìn)行的雙向藥理學(xué)調(diào)控實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證明,該過程依賴AMPK通路:AMPK激活可減輕KCMF1驅(qū)動的病理改變,而AMPK抑制會削弱KCMF1缺失帶來的保護(hù)效應(yīng)。此外,研究鑒定出黃酮類化合物rhoifolin可直接結(jié)合KCMF1,穩(wěn)定AMPKα,并改善小鼠MASLD表型。
研究結(jié)論:KCMF1通過促進(jìn)AMPKα發(fā)生K48連接的泛素化和降解,驅(qū)動MASLD發(fā)生發(fā)展。靶向KCMF1–AMPK軸可恢復(fù)肝臟代謝穩(wěn)態(tài),可能成為MASLD治療的潛在策略。
關(guān)鍵詞:鉀通道調(diào)節(jié)因子1;AMP活化蛋白激酶;代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝病;泛素化
01
研究背景及科學(xué)問題
代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝病(MASLD)是全球慢性肝病的重要原因之一,約影響全球40%的人群,并與肥胖和2型糖尿病患病率上升相伴出現(xiàn)。代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝炎(MASH)是MASLD的進(jìn)展形式,可進(jìn)一步發(fā)展為肝纖維化、肝硬化,甚至肝細(xì)胞癌,是肝病相關(guān)死亡的重要推動因素。MASH還與多種肝外并發(fā)癥有關(guān),包括2型糖尿病、心血管疾病、認(rèn)知功能下降以及慢性腎臟病。MASLD給醫(yī)療系統(tǒng)帶來沉重負(fù)擔(dān),也推動社會經(jīng)濟(jì)成本持續(xù)增加。然而,目前可用的藥物治療選擇仍然有限,亟需更有效的治療策略。因此,闡明MASLD發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,對于開發(fā)靶向治療方案具有重要意義。
AMP活化蛋白激酶(AMPK)是細(xì)胞內(nèi)重要的能量感受器,由含有催化亞基α1或α2,以及調(diào)節(jié)亞基β1或β2、γ1、γ2或γ3的異源三聚體復(fù)合物組成。在肝細(xì)胞中,AMPK激活可促進(jìn)脂肪酸氧化,并抑制脂質(zhì)生成和糖異生,因此在MASLD中具有肝臟保護(hù)作用。然而,在MASLD患者和實(shí)驗(yàn)?zāi)P椭校闻KAMPK活性和蛋白水平下降,這會促進(jìn)代謝紊亂和疾病進(jìn)展。雖然AMPK活性通過磷酸化調(diào)控的機(jī)制已經(jīng)被廣泛研究,AMPK激活劑也在MASLD臨床前模型中顯示出一定潛力,但其臨床應(yīng)用受到脫靶效應(yīng)限制。除磷酸化外,翻譯后泛素化逐漸被認(rèn)為是決定代謝組織中AMPK蛋白穩(wěn)定性和周轉(zhuǎn)的重要機(jī)制,例如骨骼肌中的MG53、脂肪組織中的MKRN1等。然而,在肝臟中,尤其是在MASLD背景下,負(fù)責(zé)AMPK泛素化和降解的特異性E3泛素連接酶仍大多尚未明確。填補(bǔ)這一機(jī)制空白,可能有助于發(fā)展新的MASLD靶向治療策略。
鉀通道調(diào)節(jié)因子1(KCMF1)是一種E3泛素連接酶,可與RAD6和UBR4形成獨(dú)特的E2-E3復(fù)合體,參與蛋白泛素化和降解。KCMF1被認(rèn)為能夠識別具有未乙酰化N端的蛋白,并將其靶向降解,從而影響細(xì)胞穩(wěn)態(tài)、壽命和運(yùn)動能力。此外,KCMF1也被報(bào)道參與調(diào)控細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,并與免疫反應(yīng)及多種人類癌癥有關(guān)。盡管已有這些認(rèn)識,KCMF1在代謝性肝病中的作用仍未被探索。
在本研究中,作者整合AMPKα互作組分析和MASLD差異蛋白質(zhì)組學(xué),發(fā)現(xiàn)KCMF1是在MASLD模型中顯著上調(diào)、并可與AMPKα相互作用的E3泛素連接酶。研究進(jìn)一步證實(shí),KCMF1可通過直接結(jié)合和K48連接的泛素化負(fù)向調(diào)控AMPKα,促進(jìn)其降解。功能獲得和功能缺失實(shí)驗(yàn)表明,KCMF1通過靶向AMPK信號通路,在體外和體內(nèi)促進(jìn)MASLD進(jìn)展。此外,AI引導(dǎo)篩選發(fā)現(xiàn)rhoifolin是一種KCMF1抑制劑,可通過維持AMPKα穩(wěn)定性和信號活性來減輕MASLD表型。這些發(fā)現(xiàn)揭示了KCMF1–AMPK軸是肝臟代謝調(diào)控中的新機(jī)制,并提示其可能成為MASLD的潛在治療靶點(diǎn)。
02
重要發(fā)現(xiàn)及亮點(diǎn)
KCMF1是MASLD中上調(diào)并富集于肝細(xì)胞的AMPKα互作E3泛素連接酶
為尋找在MASLD中介導(dǎo)AMPKα降解的E3泛素連接酶,研究者整合了高脂飲食小鼠肝臟差異蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù),以及在HepG2和HEK293T細(xì)胞中進(jìn)行的AMPKα1免疫沉淀-質(zhì)譜(IP-MS)結(jié)果。高脂飲食數(shù)據(jù)集中共鑒定出25個(gè)差異表達(dá)的E3泛素連接酶,IP-MS則發(fā)現(xiàn)17個(gè)AMPKα1互作E3泛素連接酶。兩個(gè)數(shù)據(jù)集交集得到兩個(gè)候選分子:KCMF1和TRIM25。由于KCMF1上調(diào)更明顯,約為1.8倍,且此前其在肝臟代謝中的作用尚未被闡明,因此研究者將其作為后續(xù)重點(diǎn)研究對象。
進(jìn)一步分析顯示,在高脂飲食小鼠、ob/ob小鼠以及GAN飲食小鼠肝臟中,KCMF1蛋白水平均明顯升高,而其mRNA水平并未發(fā)生顯著變化。免疫熒光結(jié)果顯示,高脂飲食小鼠肝細(xì)胞中KCMF1染色增強(qiáng),并與肝細(xì)胞標(biāo)志物肝細(xì)胞核因子4α(HNF4α)和白蛋白共定位,這與公共肝臟單細(xì)胞RNA測序數(shù)據(jù)一致。細(xì)胞類型特異性分析進(jìn)一步顯示,游離脂肪酸(FFA)處理可選擇性上調(diào)小鼠原代肝細(xì)胞中的KCMF1表達(dá),而對肝臟非實(shí)質(zhì)細(xì)胞無明顯影響。與動物實(shí)驗(yàn)一致,與對照組相比,MASLD患者肝臟中KCMF1蛋白水平也明顯升高。總體來看,這些結(jié)果表明,KCMF1是一個(gè)與AMPKα相互作用的E3泛素連接酶,在MASLD中穩(wěn)定上調(diào),并主要表達(dá)于肝細(xì)胞。
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圖1:KCMF1在MASLD中上調(diào)并富集于肝細(xì)胞。(A)篩選策略示意圖:整合高脂飲食(HFD)小鼠肝臟差異蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù),以及HepG2和HEK293T細(xì)胞中AMPKα1免疫沉淀-質(zhì)譜(IP-MS)結(jié)果,用于鑒定候選E3泛素連接酶。(B,C)正常飲食(ND)和高脂飲食小鼠肝臟中KCMF1的代表性免疫印跡圖及定量分析,每組n=6。(D,E)12周齡野生型瘦小鼠(Lean)和ob/ob小鼠肝臟中KCMF1蛋白水平,每組n=5–8。(F,G)正常飲食和GAN飲食小鼠肝臟中KCMF1豐度,每組n=4。(H,I)經(jīng)BSA或0.5 mM FFA處理24小時(shí)的原代肝細(xì)胞中KCMF1蛋白表達(dá),每組n=3次獨(dú)立實(shí)驗(yàn)。(J,K)經(jīng)BSA或0.5 mM FFA處理24小時(shí)的肝臟非實(shí)質(zhì)細(xì)胞中KCMF1蛋白表達(dá),每組n=3次獨(dú)立實(shí)驗(yàn)。(L,M)非脂肪變性或MASLD人肝臟樣本中KCMF1表達(dá),每組n=4。數(shù)據(jù)以均數(shù)±SEM表示。ns表示無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001。
KCMF1促進(jìn)AMPKα發(fā)生K48連接的泛素化和降解
在確認(rèn)KCMF1可能與AMPKα相關(guān)后,研究者進(jìn)一步驗(yàn)證二者的相互作用。分子對接結(jié)果提示KCMF1可直接結(jié)合AMPKα;共免疫沉淀實(shí)驗(yàn)顯示,KCMF1選擇性地與AMPK催化亞基AMPKα1和AMPKα2相互作用,而不與調(diào)節(jié)亞基AMPKβ1或AMPKγ1明顯結(jié)合。GST pull-down實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)KCMF1與AMPKα之間存在直接結(jié)合。為明確結(jié)合區(qū)域,研究者構(gòu)建了一系列KCMF1截短突變體。結(jié)果顯示,N端片段,即氨基酸1–60,不能與AMPKα1結(jié)合;而覆蓋中間區(qū)域和C端區(qū)域的片段,即61–151、152–224和225–381,仍保留結(jié)合能力,提示KCMF1的61–381位氨基酸對于其結(jié)合AMPKα是必要的。
隨后,研究者檢測KCMF1是否可促進(jìn)AMPKα泛素化并影響其穩(wěn)定性。結(jié)果顯示,KCMF1過表達(dá)顯著增加AMPKα泛素化;而刪除預(yù)測的催化區(qū)域,即78–101位氨基酸后,這一作用大幅減弱。泛素突變體實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步顯示,K48R而非K63R突變可削弱KCMF1介導(dǎo)的AMPKα泛素化,說明這一過程具有K48連接特異性。蛋白穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)也顯示,KCMF1敲低可延長肝細(xì)胞中AMPKα半衰期,而KCMF1過表達(dá)則縮短其半衰期。總體而言,這些結(jié)果表明,KCMF1可直接靶向AMPKα,誘導(dǎo)其發(fā)生K48連接的泛素化,并促進(jìn)其降解。
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圖2:KCMF1與AMPKα相互作用并促進(jìn)其泛素化和降解。(A)KCMF1與AMPKα的預(yù)測分子對接模型。(B)在HepG2細(xì)胞中,F(xiàn)lag-KCMF1與內(nèi)源性AMPKα1、AMPKα2、AMPKβ1和AMPKγ1的共免疫沉淀(Co-IP)分析。(C,D)在HEK293T細(xì)胞中,通過Co-IP檢測Flag-KCMF1與Myc-AMPKα1之間的相互作用。(E)使用純化的GST-KCMF1和His-AMPKα1進(jìn)行GST pull-down實(shí)驗(yàn);單獨(dú)GST作為對照。(F)全長KCMF1和截短KCMF1構(gòu)建體示意圖。(G)在HEK293T細(xì)胞中,通過Co-IP分析Myc-AMPKα1與全長或截短Flag-KCMF1構(gòu)建體之間的相互作用。(H)在共同轉(zhuǎn)染Flag-KCMF1、Myc-AMPKα和HA-Ub的HEK293T細(xì)胞中,通過免疫沉淀和免疫印跡檢測AMPKα泛素化。(I)在轉(zhuǎn)染全長KCMF1或KCMF1突變體(Δ78–101 aa)的HEK293T細(xì)胞中檢測AMPKα泛素化。(J)在HEK293T細(xì)胞中,使用HA-Ub、HA-Ub/K48R或HA-Ub/K63R突變體檢測KCMF1介導(dǎo)的AMPKα泛素化。(K–N)在經(jīng)環(huán)己酰亞胺(CHX,50 μg/mL)處理的THLE-2細(xì)胞中,檢測KCMF1敲低或過表達(dá)對AMPKα蛋白穩(wěn)定性的影響。
KCMF1促進(jìn)原代肝細(xì)胞脂質(zhì)積累和炎癥反應(yīng)
在明確KCMF1可促進(jìn)AMPKα降解后,研究者繼續(xù)在小鼠原代肝細(xì)胞中評估其功能。腺病毒介導(dǎo)的KCMF1敲低顯著減輕FFA誘導(dǎo)的脂質(zhì)積累,表現(xiàn)為油紅O染色減少和細(xì)胞內(nèi)甘油三酯含量降低。同時(shí),脂質(zhì)生成相關(guān)基因CD36、FASN、SCD1以及促炎介質(zhì)IL-1β、IL-6、TNFα的表達(dá)也下降。與其對AMPKα穩(wěn)定性的影響一致,KCMF1敲低增加AMPKα蛋白水平,并增強(qiáng)AMPKα Thr172位點(diǎn)及其下游靶點(diǎn)ACC Ser79位點(diǎn)的磷酸化。
相反,KCMF1過表達(dá)會加重FFA誘導(dǎo)的肝細(xì)胞脂肪變性和甘油三酯積累,并上調(diào)脂質(zhì)生成和炎癥相關(guān)基因表達(dá)。同時(shí),KCMF1過表達(dá)降低AMPKα蛋白水平,并減少AMPKα Thr172和ACC Ser79的磷酸化。上述結(jié)果提示,KCMF1是調(diào)控肝細(xì)胞脂質(zhì)代謝和炎癥反應(yīng)的重要分子,其作用與AMPK信號抑制密切相關(guān)。
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圖3:KCMF1促進(jìn)原代肝細(xì)胞脂質(zhì)積累和炎癥反應(yīng)。(A)原代肝細(xì)胞中KCMF1敲低實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)示意圖。(B,C)原代肝細(xì)胞中KCMF1敲低效率驗(yàn)證。(D)轉(zhuǎn)導(dǎo)表達(dá)shGFP或shKCMF1腺病毒、并經(jīng)BSA或FFA處理24小時(shí)的原代肝細(xì)胞代表性油紅O染色圖。(E)各組細(xì)胞甘油三酯(TG)含量。(F)原代肝細(xì)胞中脂質(zhì)代謝相關(guān)基因CD36、FASN、SCD1以及炎癥基因IL-1β、IL-6、TNFα的mRNA表達(dá)。(G–H)各組AMPK信號通路免疫印跡分析及蛋白水平定量。(I)原代肝細(xì)胞中KCMF1過表達(dá)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)示意圖。(J,K)原代肝細(xì)胞中KCMF1過表達(dá)效率驗(yàn)證。(L)轉(zhuǎn)導(dǎo)表達(dá)GFP或KCMF1腺病毒、并經(jīng)BSA或FFA處理24小時(shí)的原代肝細(xì)胞代表性油紅O染色圖。(M)各組細(xì)胞TG含量。(N)原代肝細(xì)胞中脂質(zhì)代謝相關(guān)基因CD36、FASN、SCD1以及炎癥基因IL-1β、IL-6、TNFα的mRNA表達(dá)。(O–P)各組AMPK信號通路免疫印跡分析及蛋白水平定量。數(shù)據(jù)以均數(shù)±SEM表示,每組n=3次獨(dú)立實(shí)驗(yàn)。比例尺為100 μm。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001。
肝臟特異性KCMF1缺失改善飲食誘導(dǎo)和遺傳性MASLD
為研究KCMF1在體內(nèi)MASLD中的作用,研究者采用AAV8-shRNA在正常飲食或高脂飲食16周的小鼠中進(jìn)行肝臟特異性KCMF1敲低,并通過Western blot確認(rèn)KCMF1在肝臟中被有效降低。結(jié)果顯示,在正常飲食條件下,KCMF1敲低影響較小;但在高脂飲食挑戰(zhàn)下,KCMF1敲低可明顯改善代謝指標(biāo)。盡管體重相近,高脂飲食條件下KCMF1缺失小鼠的空腹血糖降低,葡萄糖耐量和胰島素敏感性改善,血清脂質(zhì)譜也得到改善。
在肝臟層面,KCMF1敲低可降低ALT和AST水平,提示肝損傷減輕;同時(shí)顯著減少肝臟甘油三酯和膽固醇積累。組織學(xué)分析進(jìn)一步證實(shí),KCMF1缺失小鼠肝臟脂肪變性減輕。分子檢測顯示,KCMF1缺失抑制了脂質(zhì)攝取和脂質(zhì)生成相關(guān)基因CD36、FABP1、FATP1、FASN、PPARγ、SCD1、SREBP-1c,以及促炎介質(zhì)IL-1β、IL-6、TNFα的表達(dá)。
為驗(yàn)證這一發(fā)現(xiàn),研究者還在ob/ob小鼠中進(jìn)行AAV介導(dǎo)的KCMF1敲低。結(jié)果顯示,在體重?zé)o顯著變化的情況下,葡萄糖穩(wěn)態(tài)和胰島素敏感性同樣得到改善;肝臟脂肪變性和脂質(zhì)積累明顯減少,并伴隨脂質(zhì)生成和炎癥相關(guān)基因表達(dá)下降。這些數(shù)據(jù)共同說明,肝臟KCMF1缺失可緩解飲食誘導(dǎo)和遺傳性MASLD。
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圖4:肝臟特異性KCMF1缺失在體內(nèi)改善MASLD。(A)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和AAV8介導(dǎo)的肝臟特異性KCMF1敲低示意圖。(B,C)肝組織中KCMF1敲低效率的免疫印跡分析及定量。(D,E)各組小鼠體重和空腹血糖水平,每組n=6。(F,G)葡萄糖耐量試驗(yàn)(GTT)及對應(yīng)曲線下面積(AUC),每組n=6。(H,I)胰島素耐量試驗(yàn)(ITT)及對應(yīng)AUC。(J–M)各組血清TG、TC、ALT和AST水平。(N,O)各組肝臟TG和TC含量。(P)各組肝組織切片代表性H&E染色和油紅O染色圖,比例尺為100 μm。(Q)肝組織中脂質(zhì)攝取和脂質(zhì)生成相關(guān)基因CD36、FABP1、FATP1、FASN、PPARγ、SCD1、SREBP-1c以及炎癥相關(guān)基因IL-1β、IL-6、TNFα的相對mRNA表達(dá)。數(shù)據(jù)以均數(shù)±SEM表示。與HFD AAV-shGFP組相比,*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001;與ND AAV-shGFP組相比,<0.05,#<0.01。
為進(jìn)一步驗(yàn)證KCMF1在MASLD中的作用,研究者還通過AAV8介導(dǎo)的方式在正常飲食或高脂飲食16周的小鼠肝臟中過表達(dá)KCMF1。免疫印跡結(jié)果證實(shí),KCMF1在肝臟中被有效過表達(dá)。與敲低結(jié)果相對應(yīng),KCMF1過表達(dá)在正常飲食條件下影響有限,但在高脂飲食挑戰(zhàn)下會加重代謝紊亂。盡管體重相近,KCMF1過表達(dá)小鼠出現(xiàn)空腹血糖升高、葡萄糖耐量和胰島素敏感性受損,以及血清脂質(zhì)譜惡化。KCMF1過表達(dá)還促進(jìn)肝損傷和肝臟脂質(zhì)積累,并增強(qiáng)肝臟脂質(zhì)生成基因和炎癥基因表達(dá)。這些功能獲得實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步支持KCMF1在MASLD中的關(guān)鍵作用。
KCMF1驅(qū)動MASH模型中的脂肪性肝炎進(jìn)展
在明確KCMF1參與肝臟脂肪變性后,研究者進(jìn)一步評估其在脂肪性肝炎中的作用。小鼠接受AAV8-shKCMF1或?qū)φ蛰d體處理,隨后給予GAN飲食16周,并實(shí)現(xiàn)有效的肝臟KCMF1敲低。盡管體重未發(fā)生明顯改變,KCMF1缺失顯著緩解GAN誘導(dǎo)的脂肪性肝炎。具體表現(xiàn)為:空腹血糖以及循環(huán)甘油三酯和膽固醇水平降低;ALT和AST下降,提示肝損傷減輕;肝臟組織病理改善,脂肪變性和巨噬細(xì)胞浸潤減少。與此同時(shí),脂質(zhì)代謝相關(guān)基因CD36、SCD1、PPARγ、SREBP-1c,炎癥相關(guān)基因IL-1β、IL-6、MCP1,以及纖維化相關(guān)基因MMP13的表達(dá)均顯著下降。相反,肝臟KCMF1過表達(dá)會加重GAN飲食誘導(dǎo)的MASH,表現(xiàn)為代謝指標(biāo)惡化、肝損傷加重,以及肝臟脂肪變性和炎癥增強(qiáng)。
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圖5:肝臟KCMF1敲低緩解GAN飲食誘導(dǎo)的脂肪性肝炎。(A)AAV8介導(dǎo)的肝臟KCMF1敲低及GAN飲食喂養(yǎng)方案示意圖。(B,C)肝組織中KCMF1敲低效率的免疫印跡分析及定量。(D,E)各組體重和空腹血糖水平,每組n=6。(F–I)各組血清TG、TC、ALT和AST水平。(J)肝組織切片代表性H&E染色、油紅O染色、F4/80染色和CD11b染色圖,比例尺為100 μm;每組n=6。(K)肝組織中脂質(zhì)代謝相關(guān)基因CD36、SCD1、PPARγ、SREBP-1c,炎癥相關(guān)基因IL-1β、IL-6、MCP1,以及纖維化相關(guān)基因MMP13的相對mRNA表達(dá),每組n=6。數(shù)據(jù)以均數(shù)±SEM表示。ns表示無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001。
為進(jìn)一步判斷這些作用是否由肝細(xì)胞內(nèi)在機(jī)制介導(dǎo),研究者構(gòu)建了肝細(xì)胞特異性KCMF1敲除小鼠,并給予另一種經(jīng)典MASH模型飲食CDAHFD。結(jié)果確認(rèn)KCMF1被有效刪除。值得注意的是,肝細(xì)胞特異性KCMF1缺失顯著減輕CDAHFD誘導(dǎo)的脂肪性肝炎,表現(xiàn)為肝臟脂肪變性、炎癥和纖維化減少,同時(shí)伴隨血清脂質(zhì)水平和肝損傷指標(biāo)下降。分子分析進(jìn)一步顯示,脂質(zhì)生成相關(guān)基因FASN、SCD1、SREBP-1c,炎癥相關(guān)基因IL-1β、IL-6,以及纖維化相關(guān)基因COL1A1、COL3A1、MMP9、MMP13、TIMP1均下調(diào)。上述結(jié)果說明,肝細(xì)胞來源的KCMF1參與脂肪性肝炎進(jìn)展。
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圖6:肝細(xì)胞特異性KCMF1缺失減輕CDAHFD誘導(dǎo)的脂肪性肝炎。(A)肝細(xì)胞特異性KCMF1敲除及CDAHFD喂養(yǎng)方案示意圖。(B,C)肝組織中KCMF1刪除效率驗(yàn)證。(D,E)各組體重和空腹血糖水平,每組n=6。(F–I)各組血清TG、TC、ALT和AST水平,每組n=6。(J)肝組織切片代表性H&E染色、油紅O染色、F4/80染色、CD11b染色和Sirius Red染色圖,比例尺為100 μm。(K)肝組織中脂質(zhì)代謝相關(guān)基因FASN、SCD1、SREBP-1c,炎癥相關(guān)基因IL-1β、IL-6,以及纖維化相關(guān)基因COL1A1、COL3A1、MMP9、MMP13、TIMP1的相對mRNA表達(dá),每組n=6。數(shù)據(jù)以均數(shù)±SEM表示。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001。
KCMF1通過抑制肝臟AMPK信號促進(jìn)MASLD進(jìn)展
為探索KCMF1發(fā)揮作用的分子機(jī)制,研究者對高脂飲食條件下有無KCMF1敲低的小鼠肝臟進(jìn)行RNA測序分析。KEGG通路富集結(jié)果顯示,在KCMF1缺失后,AMPK信號通路是顯著上調(diào)的通路之一。基因集富集分析也顯示,KCMF1缺失可激活與AMPK相關(guān)的代謝程序,包括脂肪酸降解和胰島素信號通路,同時(shí)抑制NF-κB和MAPK等炎癥相關(guān)通路。
隨后,研究者在蛋白水平檢測AMPK信號。在高脂飲食小鼠中,KCMF1敲低增加總AMPKα蛋白豐度,并伴隨AMPKα Thr172位點(diǎn)及其下游靶點(diǎn)ACC1磷酸化升高,但p-AMPK/總AMPK比值并無顯著變化。相比之下,AMPKβ1和AMPKγ1水平未受影響。相反,KCMF1過表達(dá)降低總AMPKα蛋白水平,并同步降低AMPKα和ACC1磷酸化,但不影響p-AMPK/總AMPK比值,也不影響AMPKβ1和AMPKγ1水平。類似的調(diào)控模式也出現(xiàn)在GAN飲食小鼠以及CDAHFD喂養(yǎng)的肝細(xì)胞特異性KCMF1敲除小鼠中。
與AMPK調(diào)控結(jié)果一致,KCMF1缺失增強(qiáng)肝臟脂肪酸氧化,表現(xiàn)為脂肪酸氧化(FAO)活性升高,以及PPARα、CPT-1α和ACOX-1表達(dá)上調(diào);而KCMF1過表達(dá)則呈相反趨勢。
為進(jìn)一步確認(rèn)AMPK參與KCMF1的作用,研究者在體外和體內(nèi)進(jìn)行了藥理學(xué)拯救實(shí)驗(yàn)。在原代肝細(xì)胞中,使用AMPK激活劑A-769662可顯著減輕KCMF1過表達(dá)誘導(dǎo)的脂質(zhì)積累。在體內(nèi),肝臟KCMF1過表達(dá)小鼠接受GAN飲食并給予AMPK激活劑AICAR處理。結(jié)果顯示,AICAR可明顯緩解KCMF1誘導(dǎo)的代謝紊亂,表現(xiàn)為葡萄糖穩(wěn)態(tài)、血清脂質(zhì)譜和肝損傷指標(biāo)改善,并伴隨肝臟脂肪變性和巨噬細(xì)胞浸潤減少。總體來看,這些結(jié)果支持KCMF1通過抑制肝臟AMPK信號促進(jìn)MASLD進(jìn)展。
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圖7:KCMF1通過抑制肝臟AMPK信號調(diào)控MASLD進(jìn)展。(A)接受AAV-shGFP或AAV-shKCMF1處理的高脂飲食小鼠肝組織中差異表達(dá)基因火山圖。(B)差異表達(dá)基因KEGG通路富集分析氣泡圖。(C)顯示主要富集KEGG通路的弦圖。(D)NF-κB、MAPK、脂肪酸降解和胰島素信號通路等信號通路的基因集富集分析(GSEA)。(E,F(xiàn))KCMF1敲低的高脂飲食小鼠肝臟中AMPK信號組分的蛋白表達(dá)及定量,每組n=6。(G,H)KCMF1過表達(dá)的高脂飲食小鼠肝臟中AMPK信號組分的蛋白表達(dá)及定量,每組n=6。(I,J)GAN飲食喂養(yǎng)、KCMF1敲低小鼠肝臟中AMPK信號組分的蛋白表達(dá)及定量,每組n=6。(K,L)GAN飲食喂養(yǎng)、KCMF1過表達(dá)小鼠肝臟中AMPK信號組分的蛋白表達(dá)及定量,每組n=6。(M,N)CDAHFD喂養(yǎng)的肝細(xì)胞特異性KCMF1敲除小鼠肝臟中AMPK信號組分的蛋白表達(dá)及定量,每組n=4。數(shù)據(jù)以均數(shù)±SEM表示。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001。
AI篩選發(fā)現(xiàn)KCMF1抑制劑rhoifolin可通過恢復(fù)AMPK信號改善MASH
基于KCMF1通過抑制AMPK信號促進(jìn)MASLD進(jìn)展的發(fā)現(xiàn),研究者進(jìn)一步提出:靶向KCMF1可能是一種潛在治療策略。為尋找潛在KCMF1抑制劑,研究者基于KCMF1蛋白結(jié)構(gòu)建模,對小分子庫進(jìn)行了AI驅(qū)動的虛擬篩選。排名前20的小分子隨后接受表面等離子共振(SPR)驗(yàn)證,其中8個(gè)小分子與重組KCMF1表現(xiàn)出顯著結(jié)合能力。研究者進(jìn)一步選擇黃酮類化合物rhoifolin進(jìn)行深入研究。微量熱泳動(MST)證實(shí)rhoifolin可直接結(jié)合KCMF1;分子對接提示其可能與KCMF1的RING結(jié)構(gòu)域相互作用,從而影響KCMF1的E3泛素連接酶功能。
在功能層面,rhoifolin可減少FFA刺激的原代肝細(xì)胞脂質(zhì)積累,并伴隨AMPKα蛋白豐度和磷酸化增加,以及ACC1磷酸化增強(qiáng),提示AMPK信號被激活。值得注意的是,在KCMF1缺失的肝細(xì)胞中,rhoifolin降低脂質(zhì)積累的作用明顯減弱,支持rhoifolin至少部分通過靶向KCMF1發(fā)揮作用。
研究者隨后在CDAHFD誘導(dǎo)的MASH模型中評估rhoifolin的治療效果。小鼠先給予CDAHFD 4周以建立MASH病理改變,隨后在繼續(xù)CDAHFD的同時(shí)給予rhoifolin或溶媒處理4周。結(jié)果顯示,rhoifolin處理在不影響體重的情況下,可降低血清ALT和AST水平。組織學(xué)結(jié)果顯示,H&E染色和油紅O染色提示rhoifolin改善肝臟脂質(zhì)積累;F4/80和CD11b免疫熒光以及Sirius Red染色則顯示,rhoifolin處理小鼠的巨噬細(xì)胞浸潤和肝纖維化減少。在分子水平,rhoifolin增加肝臟AMPKα蛋白豐度和磷酸化水平,并增強(qiáng)ACC1磷酸化,提示其可在體內(nèi)恢復(fù)AMPK信號。
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圖8:Rhoifolin靶向KCMF1并通過恢復(fù)AMPK信號緩解MASH。(A)采用表面等離子共振(SPR)篩選20種小分子與重組KCMF1蛋白的結(jié)合情況。響應(yīng)單位(RU)表示結(jié)合親和力。具有顯著結(jié)合的小分子被突出顯示,以藍(lán)色圓點(diǎn)標(biāo)記。(B)微量熱泳動(MST)分析rhoifolin與KCMF1的結(jié)合,顯示其呈濃度依賴性相互作用,計(jì)算得到的Kd為3.29±0.41 μM。(C)Rhoifolin的化學(xué)結(jié)構(gòu)。(D)顯示rhoifolin與KCMF1相互作用的分子對接模型。(E)CDAHFD誘導(dǎo)MASH模型及rhoifolin處理方案示意圖。(F)各組體重,每組n=6。(G,H)各組血清ALT和AST水平。(I)肝組織切片代表性H&E染色、油紅O染色、F4/80染色、CD11b染色和Sirius Red染色圖,比例尺為100 μm。(J,K)CDAHFD喂養(yǎng)小鼠接受rhoifolin處理后,肝組織中KCMF1和AMPK信號組分的蛋白表達(dá)及定量。數(shù)據(jù)以均數(shù)±SEM表示。*p<0.05,**p<0.01,***p<0.001。
【貢獻(xiàn)】★★★★★
本研究鑒定出KCMF1–AMPK軸是MASLD中此前未被認(rèn)識到的調(diào)控通路,并支持KCMF1可能成為潛在治療靶點(diǎn)。調(diào)控這一軸線可能恢復(fù)AMPK信號,改善MASLD的代謝異常和病理特征,從而為現(xiàn)有治療策略提供一種補(bǔ)充性思路。
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