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      Nature Communications|膽汁酸代謝如何加速IBD?GCA壓制TRIB3-ID1軸、削弱腸干細(xì)胞更新,天然產(chǎn)物巖白菜素可逆轉(zhuǎn)!(花芳/尚爽-北協(xié)和)

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      2026年7月11日,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥物研究所尚爽、花芳團(tuán)隊(duì)等,在Nature Communications (IF=18.1,中科院綜合性期刊1區(qū)、JCR Q1)發(fā)表題為“Glycocholic Acid Inhibits TRIB3-ID1 Axis to Accelerate Colitis Progression via Suppressing Intestinal Stem Cell Renewal”的研究論文。該文于2025年8月28日投稿,2026年6月12日接收。


      炎癥性腸?。↖BD)治療的關(guān)鍵目標(biāo)之一是實(shí)現(xiàn)黏膜愈合,而腸干細(xì)胞(ISCs)的數(shù)量和再生能力是維持腸上皮修復(fù)的重要基礎(chǔ)。該研究發(fā)現(xiàn),IBD患者糞便中升高的結(jié)合型初級膽汁酸——甘氨膽酸(GCA)可通過抑制TRIB3表達(dá),破壞TRIB3-ID1軸,降低腸干細(xì)胞自我更新能力,并加重結(jié)腸炎進(jìn)展。機(jī)制上,TRIB3可與ID1相互作用,阻止ID1棕櫚?;约癆P3D1介導(dǎo)的溶酶體降解,從而維持腸干細(xì)胞干性和腸黏膜屏障完整性。

      研究進(jìn)一步通過CMAP數(shù)據(jù)庫篩選發(fā)現(xiàn),天然產(chǎn)物巖白菜素(Bergenin)可上調(diào)TRIB3表達(dá),穩(wěn)定ID1蛋白,恢復(fù)腸干細(xì)胞自我更新,并在小鼠結(jié)腸炎模型中改善腸黏膜損傷。該研究提示,靶向TRIB3-ID1軸、增強(qiáng)腸干細(xì)胞再生能力,可能為IBD黏膜修復(fù)提供新的藥物干預(yù)思路。需要注意的是,本文證據(jù)主要來自小鼠模型、細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和腸類器官實(shí)驗(yàn),不能直接等同于人體臨床療效。

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      代謝與整合生物學(xué)微信公眾號_20260713.pdf

      摘 要

      腸干細(xì)胞的數(shù)量及其再生能力,對于實(shí)現(xiàn)黏膜愈合至關(guān)重要。解析炎癥性腸病中腸干細(xì)胞受損的分子機(jī)制,可能為治療策略提供新的啟示。膽汁酸代謝改變是炎癥性腸病的典型特征之一,通常表現(xiàn)為糞便中初級膽汁酸水平升高,例如甘氨膽酸(glycocholic acid,GCA)。然而,GCA與炎癥性腸病之間的關(guān)系仍不清楚。

      本研究發(fā)現(xiàn),GCA可通過下調(diào)TRIB3表達(dá)、破壞腸干細(xì)胞自我更新,從而加速炎癥性腸病進(jìn)展。TRIB3在腸隱窩細(xì)胞中高度表達(dá),并通過阻止ID1棕櫚?;癆P3D1介導(dǎo)的溶酶體降解,維持腸上皮干性。研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),GCA可抑制TRIB3-ID1軸,進(jìn)而損害腸上皮完整性。

      值得注意的是,研究鑒定出天然化合物巖白菜素(Bergenin)可通過上調(diào)TRIB3,成為潛在的抗炎癥性腸病治療候選物。上述發(fā)現(xiàn)提示,TRIB3-ID1軸可能是炎癥性腸病治療中值得關(guān)注的潛在靶點(diǎn)。

      01

      研究背景及科學(xué)問題

      代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝?。∕ASLD)和代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝炎(MASH)是全球最常見的肝臟疾病之一,其中約20%—30%的MASLD病例可能進(jìn)展為MASH。長期暴露于西方飲食(WD)可導(dǎo)致腸道菌群失衡、慢性低度腸道炎癥和代謝紊亂,其不利影響已得到廣泛關(guān)注。

      腸屏障在多種代謝性疾病中發(fā)揮關(guān)鍵作用,尤其與肝臟和肺部炎癥及纖維化密切相關(guān)。腸道微生物組成和菌群來源代謝物與MASH嚴(yán)重程度及肺部炎癥相關(guān)。腸屏障受損后,細(xì)菌及其產(chǎn)物更容易發(fā)生移位,進(jìn)而激活并募集局部和外周免疫細(xì)胞,推動肝臟和肺部功能異常。因此,理解西方飲食如何影響腸屏障功能,對于認(rèn)識飲食干預(yù)對健康的整體影響具有重要意義。

      神經(jīng)酰胺代謝被認(rèn)為參與MASH發(fā)生。神經(jīng)酰胺酶是一類可將神經(jīng)酰胺分解為鞘氨醇和脂肪酸的酶。已有研究報(bào)道,堿性神經(jīng)酰胺酶3和酸性神經(jīng)酰胺酶缺失可減輕MASH小鼠模型中的炎癥和纖維化。中性神經(jīng)酰胺酶由Asah2基因編碼,主要表達(dá)于肝臟和小腸。作者團(tuán)隊(duì)此前使用全身性中性神經(jīng)酰胺酶敲除小鼠發(fā)現(xiàn),中性神經(jīng)酰胺酶是腸道IgA產(chǎn)生型B細(xì)胞的功能調(diào)節(jié)因子,可改變腸道菌群并加速M(fèi)ASH進(jìn)展。然而,腸道中性神經(jīng)酰胺酶在MASH進(jìn)展中的具體作用仍未明確。

      腸上皮屏障功能部分受黏膜上皮糖鏈系統(tǒng)調(diào)節(jié),其中包括巖藻糖基化。巖藻糖基化糖鏈由巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶(fucosyltransferases,F(xiàn)uts)合成。Fut1和Fut2可使腸上皮細(xì)胞表達(dá)α1-2巖藻糖基化碳水化合物。既往研究顯示,腸上皮α1-2巖藻糖基化在宿主-菌群互作中具有重要作用,并參與酒精相關(guān)肝病和結(jié)腸炎。Fut2缺失導(dǎo)致α1-2巖藻糖基化不足,可加重慢性乙醇誘導(dǎo)的肝損傷、脂肪變和炎癥。

      然而,腸上皮中性神經(jīng)酰胺酶是否通過調(diào)節(jié)腸道巖藻糖基化影響MASH,仍是一個(gè)未解決問題。本研究利用腸上皮細(xì)胞特異性Asah2缺失小鼠(Asah2ΔIEC),探討腸道中性神經(jīng)酰胺酶如何影響腸道菌群、微生物代謝物和上皮屏障功能,并重點(diǎn)分析芳香烴受體(aryl hydrocarbon receptor,AhR)信號及菌群來源代謝物2-HHA在調(diào)控腸道巖藻糖基化和疾病進(jìn)展中的作用。

      炎癥性腸?。╥nflammatory bowel disease,IBD)包括潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)和克羅恩?。–rohn’s disease,CD),是一類慢性、復(fù)發(fā)性疾病,全球患病率持續(xù)上升。黏膜愈合(mucosal healing,MH)已被廣泛認(rèn)為是誘導(dǎo)IBD長期緩解所需達(dá)到的重要治療目標(biāo)。

      然而,目前可用的IBD治療方式大多通過抑制炎癥來促進(jìn)黏膜愈合,仍不足以完全治愈IBD。考慮到長期免疫抑制治療可能帶來感染風(fēng)險(xiǎn),在不依賴免疫抑制的情況下實(shí)現(xiàn)黏膜愈合,成為一個(gè)具有吸引力的治療方向。

      腸上皮細(xì)胞(intestinal epithelial cells,IECs)形成單層屏障,是腸黏膜屏障最基本的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),可將宿主與腸腔內(nèi)有害內(nèi)容物分隔開來。腸干細(xì)胞(intestinal stem cells,ISCs)位于腸隱窩底部的干細(xì)胞生態(tài)位中,其功能紊亂或數(shù)量減少,是腸上皮細(xì)胞更新失敗和腸黏膜屏障破壞的重要原因。

      提高腸干細(xì)胞數(shù)量或增強(qiáng)其再生能力,有助于促進(jìn)黏膜愈合。例如,類器官移植等方法已在IBD小鼠模型中顯示出促進(jìn)長期緩解的潛力,但類器官遞送等技術(shù)難題限制了其進(jìn)一步應(yīng)用。另一方面,激活STAT3/STAT5、Hippo-YAP/TAZ等促增殖信號可促進(jìn)腸干細(xì)胞增殖,并在損傷后加速隱窩再生。這些發(fā)現(xiàn)提示,解析IBD中腸干細(xì)胞受損的分子機(jī)制,可能幫助發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)和促進(jìn)黏膜愈合的新策略。

      多個(gè)IBD患者隊(duì)列研究均顯示,患者糞便中結(jié)合型初級膽汁酸升高,而次級膽汁酸減少,提示膽汁酸代謝紊亂與IBD進(jìn)展密切相關(guān)。原發(fā)性硬化性膽管炎(primary sclerosing cholangitis,PSC)是一種常見慢性膽汁淤積性肝病,其特點(diǎn)是膽汁淤積和膽汁酸穩(wěn)態(tài)受損。值得注意的是,多達(dá)80%的PSC患者可合并IBD,尤其是UC;而IBD患者中僅約1%—2%會進(jìn)展為PSC。這種共病差異提示,膽汁酸穩(wěn)態(tài)受損可能是IBD發(fā)生和進(jìn)展的潛在原因之一。

      已有研究顯示,石膽酸(lithocholic acid,LCA)和膽酸(cholic acid,CA)代謝紊亂可通過調(diào)控免疫反應(yīng)或腸干細(xì)胞干性特征參與IBD進(jìn)展。GCA是一種結(jié)合型初級膽汁酸,在IBD患者糞便中豐度升高。然而,GCA在IBD中的具體功能此前尚未得到系統(tǒng)研究。

      Tribbles同源蛋白3(Tribbles homolog 3,TRIB3)被認(rèn)為是一種應(yīng)激感受器,作者團(tuán)隊(duì)此前已在多種腫瘤疾病中對其進(jìn)行了系統(tǒng)研究。這些研究顯示,TRIB3可支持結(jié)直腸癌、乳腺癌、肺癌和血液系統(tǒng)惡性腫瘤中腫瘤細(xì)胞的干性特征。其他研究也提示,TRIB3參與維持正常體細(xì)胞干性。例如,TRIB3可通過與PPAR相互作用抑制脂肪細(xì)胞分化;TRIB3表達(dá)升高有助于維持小鼠精原干細(xì)胞樣特征。然而,TRIB3在維持腸干細(xì)胞干性和調(diào)控IBD進(jìn)展中的作用仍不清楚。

      本研究表明,TRIB3在腸隱窩中高度表達(dá),并通過與分化抑制蛋白1(inhibitor of differentiation protein 1,ID1)相互作用、提高其蛋白穩(wěn)定性,維持腸干細(xì)胞干性。ID1是腸干/祖細(xì)胞標(biāo)志物之一。GCA可下調(diào)TRIB3表達(dá),加速ID1降解,進(jìn)而損害儲備干細(xì)胞(reserve stem cells,RSCs)和隱窩基底柱狀細(xì)胞(crypt base columnar cells,CBCs)。研究還發(fā)現(xiàn),天然產(chǎn)物巖白菜素可通過上調(diào)TRIB3表達(dá),增強(qiáng)腸干細(xì)胞自我更新并緩解結(jié)腸炎進(jìn)展。這提示,提高TRIB3表達(dá)可能成為促進(jìn)IBD中腸干細(xì)胞自我更新和黏膜愈合的一種潛在策略。

      02

      重要發(fā)現(xiàn)及亮點(diǎn)

      GCA損害腸干細(xì)胞自我更新并加速IBD進(jìn)展

      既往研究顯示,與健康對照相比,IBD患者糞便中結(jié)合型膽汁酸GCA顯著升高,接近10倍;活動期UC患者的GCA水平也高于緩解期患者。基于這一臨床現(xiàn)象,研究首先探索GCA在結(jié)腸炎進(jìn)展中的潛在作用。

      葡聚糖硫酸鈉(dextran sulfate sodium,DSS)誘導(dǎo)的結(jié)腸炎小鼠模型是研究IBD的重要工具。研究發(fā)現(xiàn),與此前報(bào)道的膽酸不同,DSS處理本身并未顯著升高C57BL/6J小鼠糞便中的GCA水平。因此,研究人員通過灌胃方式給予DSS誘導(dǎo)結(jié)腸炎小鼠外源性GCA。200 mg/kg GCA處理可使小鼠糞便GCA濃度接近1000 nmol/g,與人類IBD患者中觀察到的平均膽汁酸豐度接近。基于這一人源模擬濃度,研究選擇200 mg/kg GCA和較低劑量100 mg/kg GCA開展UC模型中的功能實(shí)驗(yàn)。

      在DSS處理的雄性C57BL/6J小鼠中,GCA以劑量依賴方式加重結(jié)腸炎。接受200 mg/kg GCA的小鼠相較Vehicle對照出現(xiàn)額外約10%的體重下降、疾病活動指數(shù)(disease activity index,DAI)升高以及結(jié)腸長度縮短。組織病理學(xué)評估顯示,GCA處理后結(jié)腸出現(xiàn)更大范圍的隱窩丟失、糜爛和上皮黏膜損傷。

      鑒于黏膜屏障功能障礙在IBD中的關(guān)鍵作用,研究采用FITC-右旋糖酐評估腸通透性。結(jié)果顯示,GCA顯著升高血清FITC-右旋糖酐水平,提示腸屏障滲漏加重。同時(shí),GCA下調(diào)結(jié)腸組織中緊密連接相關(guān)基因Tjp1和Cdh1的表達(dá),與腸上皮屏障“滲漏”表型一致。類似結(jié)果也在雌性C57BL/6J小鼠中得到驗(yàn)證。

      為了判斷GCA單獨(dú)補(bǔ)充是否足以啟動結(jié)腸炎,研究人員向健康C57BL/6J小鼠給予200 mg/kg GCA。與DSS條件下觀察到的情況類似,GCA處理可誘導(dǎo)約4%的體重下降、DAI升高以及明顯結(jié)腸縮短,并可觀察到輕度結(jié)腸上皮黏膜損傷。這些結(jié)果共同說明,GCA補(bǔ)充可加重腸道損傷。

      進(jìn)一步機(jī)制探索顯示,GCA并不通過直接增強(qiáng)炎癥反應(yīng)來加重結(jié)腸炎。研究人員在體外使用骨髓來源單核/巨噬細(xì)胞,以及初始CD4+ T細(xì)胞進(jìn)行實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)300 μM GCA并不明顯影響CD11b+髓系細(xì)胞增殖,也不影響CD11b+F4/80+巨噬細(xì)胞向M1或M2表型極化。同時(shí),GCA不影響初始CD4+ T細(xì)胞增殖,也不影響其向TH1細(xì)胞分化。結(jié)合已有研究中GCA對TH17或Treg分化無明顯影響的結(jié)果,作者認(rèn)為,GCA并非主要通過直接增強(qiáng)免疫炎癥反應(yīng)加重結(jié)腸炎。

      隨后,研究重點(diǎn)轉(zhuǎn)向腸上皮黏膜屏障。GCA顯著降低結(jié)腸組織中EdU+細(xì)胞比例和Cdh1蛋白表達(dá),提示其抑制腸上皮細(xì)胞增殖并破壞屏障完整性。腸隱窩中有兩類ISCs參與上皮穩(wěn)態(tài)和再生:以Lgr5和Olfm4為標(biāo)志的CBCs,以及以Bmi1和Dclk1為標(biāo)志的RSCs。GCA處理降低了這4種ISC標(biāo)志物的mRNA表達(dá),并減少Bmi1+ RSCs數(shù)量。利用Lgr5-EGFP-CreERT2轉(zhuǎn)基因小鼠,研究進(jìn)一步證實(shí),GCA給藥降低了Lgr5表達(dá),但并未改變結(jié)腸切片中Lgr5+ CBCs數(shù)量。來源于GCA處理結(jié)腸炎小鼠的結(jié)腸和小腸類器官,其增殖速度均低于未處理組。

      此外,體外腸類器官通透性實(shí)驗(yàn)顯示,在正常條件下,結(jié)腸或小腸類器官對4 kDa FITC-右旋糖酐通透性很低;而經(jīng)300 μM GCA處理24小時(shí)后,類器官腔內(nèi)出現(xiàn)強(qiáng)熒光信號,與陽性對照IL-1β處理相似。上述結(jié)果表明,GCA可通過減少和削弱腸干細(xì)胞功能、損害上皮屏障完整性,從而加重結(jié)腸炎。


      圖1:GCA補(bǔ)充損害腸干細(xì)胞自我更新和黏膜屏障完整性,從而加速IBD進(jìn)展。a,GCA處理示意圖。b、c,體重變化(b)和疾病活動指數(shù)DAI(c)。d,代表性結(jié)腸大體圖像及結(jié)腸長度統(tǒng)計(jì)。e,結(jié)腸組織H&E染色代表性圖像及組織學(xué)評分統(tǒng)計(jì)。比例尺=1 mm(上圖)或50 μm(下圖)。f,血清FITC-右旋糖酐相對豐度。g,結(jié)腸組織中緊密連接相關(guān)基因的相對mRNA表達(dá)。h,結(jié)腸組織中EdU和Cdh1染色代表性圖像及統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。比例尺=20 μm。i,結(jié)腸組織中Bmi1免疫熒光染色代表性圖像,以及每個(gè)隱窩中Bmi1+細(xì)胞數(shù)量的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(n=5個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。比例尺=5 μm。j、k,在接受或未接受GCA處理的Lgr5-EGFP-IRES-creERT2小鼠結(jié)腸組織中,通過流式細(xì)胞術(shù)分析Lgr5-FITC的代表性直方圖(j),以及結(jié)腸黏膜中Lgr5+細(xì)胞比例的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(k)。l,結(jié)腸類器官代表性圖像(左)及增殖曲線(右)(n=10個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。比例尺=200 μm。m,圖l所述結(jié)腸類器官中EdU染色代表性圖像及統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。比例尺=20 μm。n,在經(jīng)或未經(jīng)GCA(300 μM)或IL-1β(50 ng/mL)處理24小時(shí)的小鼠結(jié)腸類器官中檢測FITC-右旋糖酐通透性。比例尺=50 μm。數(shù)據(jù)以均值±SEM表示,并采用Kruskal-Wallis檢驗(yàn)(c、g-Cdh1和n)、普通單因素方差分析(b、d–f、g-Tjp1)、非配對雙尾Student t檢驗(yàn)(h、j–m)和Mann-Whitney U檢驗(yàn)(i)進(jìn)行分析。NS表示無統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性。a–d、f–h、m和n中n=6個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);e、j和k中n=3個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)。誤差線表示95%置信區(qū)間。圖a元素使用BioRender創(chuàng)建:shang, S. (2026) https://BioRender.com/tbfxh4l。

      TRIB3缺失加重結(jié)腸炎,而TRIB3過表達(dá)減輕結(jié)腸炎

      作者此前研究發(fā)現(xiàn),TRIB3可維持結(jié)直腸癌細(xì)胞干性。本研究進(jìn)一步顯示,TRIB3也參與調(diào)控腸上皮細(xì)胞自我更新。免疫組織化學(xué)染色顯示,在人和小鼠結(jié)腸及小腸組織中,TRIB3蛋白在隱窩基底區(qū)域表達(dá)較高,而在更分化的上皮細(xì)胞中表達(dá)較低。研究人員從健康C57BL/6J小鼠小腸中分離隱窩細(xì)胞和絨毛細(xì)胞,也發(fā)現(xiàn)TRIB3的mRNA和蛋白豐度在隱窩中高于絨毛。

      為進(jìn)一步探究TRIB3在ISCs中的功能,研究人員構(gòu)建了腸上皮細(xì)胞特異性Trib3敲除小鼠(Trib3IEC-KO)。Trib3缺失下調(diào)了結(jié)腸和小腸隱窩中Lgr5及Bmi1蛋白表達(dá),并減少Bmi1+ RSCs數(shù)量、降低Lgr5表達(dá)。來源于Trib3IEC-KO小鼠的結(jié)腸或小腸類器官增殖受抑,提示ISCs自我更新能力下降。同時(shí),Trib3缺失增強(qiáng)了腸類器官對4 kDa FITC-右旋糖酐的通透性,其效果與體外GCA處理類似,說明Trib3對維持腸上皮屏障完整性十分重要。

      接下來,研究人員分析TRIB3在結(jié)腸炎進(jìn)展中的作用。GEO數(shù)據(jù)集GSE11223和GSE105074顯示,與健康組織相比,UC患者炎癥性腸組織中的TRIB3 mRNA豐度較低。隨后,在慢性和急性實(shí)驗(yàn)性結(jié)腸炎小鼠模型中,腸上皮特異性Trib3刪除均加速了體重下降、升高DAI、縮短結(jié)腸長度,并上調(diào)結(jié)腸黏膜炎癥因子mRNA表達(dá)。組織病理學(xué)評估進(jìn)一步顯示,Trib3缺失加重黏膜糜爛、黏膜下水腫和隱窩結(jié)構(gòu)破壞。Trib3缺失還導(dǎo)致血清FITC-右旋糖酐水平升高、緊密連接相關(guān)基因表達(dá)下降,提示黏膜屏障功能受損。

      在腸上皮再生層面,EdU與Cdh1共免疫熒光染色顯示,Trib3缺失降低結(jié)腸上皮細(xì)胞增殖和Cdh1表達(dá)。Trib3缺失還抑制結(jié)腸黏膜中CBC標(biāo)志物L(fēng)gr5、Olfm4以及RSC標(biāo)志物Bmi1、Dclk1的mRNA豐度。體外培養(yǎng)系統(tǒng)中,慢性UC模型來源的腸類器官在Trib3IEC-KO組中增殖能力低于對照組。

      相反,在DSS誘導(dǎo)的UC模型中,研究人員利用腺相關(guān)病毒(AAV)過表達(dá)Trib3。結(jié)果顯示,Trib3過表達(dá)減輕體重下降、降低DAI,并加速DSS誘導(dǎo)結(jié)腸炎的恢復(fù)。小鼠處死后,Trib3過表達(dá)可緩解結(jié)腸縮短,并降低結(jié)腸組織中炎癥因子表達(dá)。組織病理學(xué)評估顯示,腸道Trib3過表達(dá)有效減輕糜爛和腸道水腫,并保留更多完整隱窩結(jié)構(gòu)。同時(shí),Trib3過表達(dá)降低血清FITC-右旋糖酐含量,上調(diào)結(jié)腸黏膜中緊密連接相關(guān)基因mRNA水平,提示黏膜屏障更加完整。


      圖2:腸道Trib3缺失加速結(jié)腸炎進(jìn)展,而Trib3過表達(dá)延緩結(jié)腸炎進(jìn)展。a、b,根據(jù)GSE11223數(shù)據(jù)集(HC組n=69,UC組n=63)(a)和GSE105074數(shù)據(jù)集(HC組n=28,UC組n=23)(b),分析正常非炎癥結(jié)腸組織(縮寫為HC)和UC炎癥結(jié)腸組織(縮寫為UC)中TRIB3 mRNA表達(dá)。c,慢性UC小鼠模型示意圖。d、e,體重變化(d)和DAI(e)。f,代表性結(jié)腸大體圖像及結(jié)腸長度統(tǒng)計(jì)。g,相對mRNA表達(dá)。h,代表性H&E染色及組織學(xué)評分統(tǒng)計(jì)。比例尺=1 mm(上圖)或50 μm(下圖)。i,血清FITC-右旋糖酐相對豐度。j,相對mRNA表達(dá)。k,代表性EdU和Cdh1染色。比例尺=20 μm。l,相對mRNA表達(dá)。m,結(jié)腸類器官代表性圖像(左)及增殖曲線(右)(n=10個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。比例尺=200 μm。n,結(jié)腸類器官中代表性EdU染色。比例尺=20 μm。o,急性重癥UC小鼠模型示意圖。p,結(jié)腸黏膜中Trib3免疫印跡。q、r,體重變化(q)和DAI(r)。s,代表性結(jié)腸大體圖像及結(jié)腸長度統(tǒng)計(jì)。t,相對mRNA表達(dá)。u,代表性H&E染色及組織學(xué)評分統(tǒng)計(jì)。比例尺=1 mm(上圖)或50 μm(下圖)。v,小鼠血清中FITC熒光相對水平。w,結(jié)腸組織中相對mRNA表達(dá)。數(shù)據(jù)以均值±SEM表示,并采用非配對雙尾Student t檢驗(yàn)(a、d、f–k左、m、p、q、t-Tnf-α、u和w)、Mann-Whitney U檢驗(yàn)(e、n、r、s和t-IL-1β)及Welch t檢驗(yàn)(b、k右、l、t-IL-6和v)進(jìn)行分析。h、p和u中n=3個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);c–g、i–l、n、o和q中n=6個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);r–t、v和w中Ctrl組n=4、Trib3OE組n=6。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)。誤差線表示95%置信區(qū)間。圖c和o元素使用BioRender創(chuàng)建:shang, S. (2026) https://BioRender.com/tbfxh4l。

      GCA通過下調(diào)ATF4介導(dǎo)的TRIB3轉(zhuǎn)錄來破壞腸干細(xì)胞功能

      研究隨后追問:GCA是否會影響TRIB3表達(dá)?結(jié)果顯示,無論是在UC小鼠模型中,還是在人正常結(jié)腸黏膜來源NCM460細(xì)胞中,GCA處理均下調(diào)TRIB3表達(dá)。

      機(jī)制上,GCA降低TRIB3 mRNA表達(dá)。即便同時(shí)使用MG132和bafilomycin抑制蛋白酶體和溶酶體降解通路,GCA仍可降低TRIB3蛋白表達(dá),提示GCA主要抑制TRIB3轉(zhuǎn)錄,而不是影響TRIB3蛋白穩(wěn)定性。

      已有研究報(bào)道,ATF4、β-catenin、CHOP、FOXO1和SMAD3可作為TRIB3轉(zhuǎn)錄因子。研究人員在NCM460細(xì)胞中使用TRIB3啟動子熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)發(fā)現(xiàn),只有敲低ATF4能夠挽救GCA誘導(dǎo)的TRIB3轉(zhuǎn)錄降低。與此一致,敲低ATF4也可阻斷GCA誘導(dǎo)的TRIB3蛋白下降。此外,GCA本身可下調(diào)ATF4蛋白表達(dá)。這些結(jié)果說明,GCA可通過下調(diào)關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄激活因子ATF4,抑制TRIB3轉(zhuǎn)錄。

      進(jìn)一步研究顯示,GCA通過下調(diào)TRIB3促進(jìn)結(jié)腸炎。Trib3過表達(dá)在很大程度上恢復(fù)了GCA給藥引起的體重下降和DAI升高,也緩解GCA誘導(dǎo)的結(jié)腸縮短和結(jié)腸組織炎癥因子表達(dá)升高。組織病理學(xué)分析顯示,與GCA處理組相比,腸道Trib3過表達(dá)可顯著減輕黏膜糜爛和水腫,并保留隱窩結(jié)構(gòu)完整性。

      此外,Trib3過表達(dá)可逆轉(zhuǎn)GCA導(dǎo)致的血清FITC-右旋糖酐升高,以及結(jié)腸黏膜緊密連接相關(guān)基因mRNA表達(dá)下降,提示黏膜屏障完整性得到恢復(fù)。Trib3過表達(dá)還顯著挽救GCA在DSS誘導(dǎo)UC小鼠中造成的結(jié)腸上皮細(xì)胞增殖下降和屏障破壞,并恢復(fù)GCA抑制的ISC標(biāo)志物表達(dá)。來源于小鼠的結(jié)腸類器官實(shí)驗(yàn)也顯示,Trib3過表達(dá)可挽救GCA抑制的類器官增殖和通透性異常。

      總體而言,GCA處理可通過抑制腸上皮中ATF4介導(dǎo)的TRIB3轉(zhuǎn)錄,加速腸屏障破壞和結(jié)腸炎進(jìn)展。


      圖3:GCA通過下調(diào)TRIB3,損害腸干細(xì)胞增殖并破壞黏膜屏障完整性,從而加重結(jié)腸炎。a,接受或未接受200 mg/kg GCA處理小鼠結(jié)腸黏膜中Trib3免疫印跡(左)及相對蛋白水平統(tǒng)計(jì)(右)。b,不同劑量GCA處理NCM460細(xì)胞后TRIB3免疫印跡(左)及相對蛋白水平統(tǒng)計(jì)(右)。c,接受或未接受GCA處理NCM460細(xì)胞中TRIB3相對mRNA表達(dá)。d,NCM460細(xì)胞中,在有或無MG132和bafilomycin加入條件下,GCA處理后TRIB3免疫印跡。e、f,轉(zhuǎn)染Ctrl或ATF4特異性siRNA的NCM460細(xì)胞在接受或不接受300 μM GCA處理后,TRIB3報(bào)告基因熒光素酶相對活性(e)及TRIB3和ATF4免疫印跡(f)(e中n=4個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。g、h,UC小鼠模型示意圖。小鼠體重變化(g)和DAI(h)。i,代表性結(jié)腸大體圖像及結(jié)腸長度統(tǒng)計(jì)。j,所示各組小鼠結(jié)腸黏膜中相對mRNA表達(dá)。k,代表性H&E染色及組織學(xué)評分統(tǒng)計(jì)。比例尺=1 mm(上圖)或50 μm(下圖)。l,血清FITC-右旋糖酐相對豐度。m,結(jié)腸組織中緊密連接相關(guān)基因相對mRNA表達(dá)。n,相對mRNA表達(dá)。o,小鼠來源結(jié)腸類器官代表性圖像及增殖曲線(n=10個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。比例尺=200 μm。p,代表性EdU染色及統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)(n=6個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。比例尺=10 μm。數(shù)據(jù)以均值±SEM表示,并采用普通單因素方差分析(b、d–i、j-IL-1β/IL-6、k、l、m、n-Lgr5/Olfm4、o和p)、Welch t檢驗(yàn)(a)、非配對雙尾Student t檢驗(yàn)(c)、Brown-Forsythe和Welch方差分析(n-Bmi1/Dclk1)以及Kruskal-Wallis檢驗(yàn)(j-Tnf-α)進(jìn)行分析。a–d、f和k中n=3個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);g–j、l–n中n=6個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)。誤差線表示95%置信區(qū)間。圖g元素使用BioRender創(chuàng)建:shang, S. (2026) https://BioRender.com/tbfxh4l。

      GCA誘導(dǎo)TRIB3丟失,降低ID1蛋白穩(wěn)定性并損害腸干細(xì)胞再生

      研究進(jìn)一步探索GCA介導(dǎo)的TRIB3蛋白下降如何損害ISC功能并促進(jìn)IBD進(jìn)展。研究人員首先采用基因集富集分析(GSEA)尋找與TRIB3相關(guān)的干性信號通路。然而,無論是在UC患者mRNA芯片數(shù)據(jù)集,還是在Ctrl與TRIB3OE NCM460細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中,TRIB3高表達(dá)或TRIB3過表達(dá)組均未顯著富集經(jīng)典ISC相關(guān)信號通路,如Wnt、Notch或Hippo-YAP通路。

      鑒于TRIB3通常作為支架蛋白影響結(jié)合伙伴的穩(wěn)定性和轉(zhuǎn)錄調(diào)控,研究人員推測其在腸上皮中的功能也可能通過蛋白-蛋白相互作用實(shí)現(xiàn)。作者團(tuán)隊(duì)此前通過酵母雙雜交篩選發(fā)現(xiàn)多種TRIB3互作蛋白,其中ID1是唯一與ISC干性維持密切相關(guān)的蛋白,并在腸道RSCs和CBCs中均高度表達(dá)。

      通過共免疫沉淀(Co-IP)、鄰近連接實(shí)驗(yàn)(proximity ligation assay,PLA)和多重免疫組化分析,研究確認(rèn)TRIB3與ID1在人胚腎HEK293T細(xì)胞、NCM460細(xì)胞及人結(jié)腸組織中存在直接相互作用。進(jìn)一步互作區(qū)域定位顯示,TRIB3激酶結(jié)構(gòu)域的N端區(qū)域,以及ID1的N端或螺旋-環(huán)-螺旋(HLH)結(jié)構(gòu)域,對二者結(jié)合至關(guān)重要。

      進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在急性UC模型結(jié)腸組織和NCM460細(xì)胞中,TRIB3缺失會下調(diào)ID1蛋白表達(dá)。GCA給藥同樣降低Id1蛋白表達(dá),而Trib3過表達(dá)可挽救這一變化。機(jī)制上,TRIB3過表達(dá)并不影響NCM460細(xì)胞中ID1 mRNA表達(dá),但可延長HEK293T細(xì)胞中ID1蛋白半衰期;相反,敲低TRIB3會縮短N(yùn)CM460細(xì)胞中ID1半衰期。這說明TRIB3可與ID1相互作用,并增強(qiáng)其在腸上皮中的蛋白穩(wěn)定性。

      為了驗(yàn)證ID1是否是TRIB3調(diào)控ISC功能和IBD進(jìn)展的關(guān)鍵下游效應(yīng)因子,研究人員在DSS聯(lián)合GCA誘導(dǎo)的UC模型中,于Id1敲除小鼠中過表達(dá)Trib3。結(jié)果顯示,Id1缺失后,Trib3過表達(dá)對體重下降、DAI、結(jié)腸長度、組織學(xué)評分和腸通透性的保護(hù)作用全部消失。同時(shí),在Id1敲除背景下,Trib3過表達(dá)不再影響腸上皮細(xì)胞增殖,也不再調(diào)控RSC和CBC標(biāo)志物mRNA豐度。

      這些結(jié)果表明,TRIB3通過與ID1直接相互作用來穩(wěn)定ID1;GCA誘導(dǎo)的TRIB3下調(diào)會降低ID1蛋白穩(wěn)定性,進(jìn)而損害ISC自我更新和上皮屏障完整性,并加速IBD進(jìn)展。


      圖4:GCA誘導(dǎo)的TRIB3丟失降低ID1蛋白穩(wěn)定性,破壞腸干細(xì)胞再生并加速IBD進(jìn)展。a,用于篩選TRIB3互作蛋白的酵母雙雜交系統(tǒng)示意圖。b,共轉(zhuǎn)染所示表達(dá)質(zhì)粒的HEK293T細(xì)胞提取物,用IgG或抗HA抗體進(jìn)行免疫沉淀。c,通過PLA定義TRIB3與ID1之間的相互作用(n=8個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。比例尺=5 μm。d,人結(jié)腸組織中TRIB3和ID1的免疫熒光染色。比例尺=20或5 μm。e,急性UC模型中Trib3f/f和Trib3IEC-KO小鼠結(jié)腸黏膜Id1和Trib3免疫印跡。f,沉默TRIB3對NCM460細(xì)胞ID1表達(dá)的影響。g,UC模型中所示小鼠結(jié)腸黏膜Id1和Trib3免疫印跡。h,所示NCM460細(xì)胞組中ID1和TRIB3免疫印跡。i,HEK293T細(xì)胞中TRIB3過表達(dá)對ID1蛋白穩(wěn)定性的影響。虛線與降解曲線的交點(diǎn)表示半衰期。j,NCM460細(xì)胞中沉默TRIB3對ID1蛋白穩(wěn)定性的影響。k,DSS誘導(dǎo)急性UC小鼠模型示意圖。l、m,所示各組小鼠體重變化(l)和DAI(m)。n,所示各組代表性結(jié)腸大體圖像及結(jié)腸長度統(tǒng)計(jì)。o,所示各組代表性H&E染色及組織學(xué)評分統(tǒng)計(jì)。比例尺=1 mm(上圖)或50 μm(下圖)。p,血清FITC-右旋糖酐相對豐度。q,EdU免疫熒光染色代表性圖像及統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。比例尺=20 μm。r,相對mRNA表達(dá)。數(shù)據(jù)以均值±SEM表示,并采用非配對雙尾Student t檢驗(yàn)(e、f、l–o、q和r)、普通單因素方差分析(g和h)以及Mann-Whitney U檢驗(yàn)(p)進(jìn)行分析。b、d–j、o和q中n=3個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);Id1KO-Ctrl組中n=5個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn),Id1KO-Trib3OE組中n=6個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn),用于k–n、p和r。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)。誤差線表示95%置信區(qū)間。圖k元素使用BioRender創(chuàng)建:shang, S. (2026) https://BioRender.com/tbfxh4l。

      TRIB3阻止ID1棕櫚酰化和溶酶體降解

      研究進(jìn)一步解析TRIB3調(diào)控ID1蛋白穩(wěn)定性的分子機(jī)制。結(jié)果顯示,bafilomycin處理可以挽救TRIB3缺失誘導(dǎo)的ID1蛋白下降,而MG132不能產(chǎn)生類似效果,提示ID1減少主要與溶酶體降解有關(guān)。TRIB3過表達(dá)還可削弱ID1與溶酶體相關(guān)膜蛋白1(LAMP1)的共定位。這說明TRIB3可抑制ID1的溶酶體降解。

      作者團(tuán)隊(duì)此前發(fā)現(xiàn),TRIB3可與自噬受體p62相互作用,抑制p62介導(dǎo)的泛素化底物溶酶體降解。由于泛素化ID1已知可與p62結(jié)合并進(jìn)入自噬-溶酶體降解途徑,研究人員最初假設(shè)TRIB3可能通過破壞ID1-p62相互作用或影響ID1泛素化來穩(wěn)定ID1。然而,Co-IP實(shí)驗(yàn)顯示,TRIB3缺失并不影響ID1-p62相互作用,也不影響ID1泛素化。

      為了尋找替代機(jī)制,研究人員在NCM460細(xì)胞中進(jìn)行了Co-IP聯(lián)合半定量質(zhì)譜分析。結(jié)果顯示,在ID1免疫沉淀物中檢測到AP3D1。AP3D1是溶酶體貨物轉(zhuǎn)運(yùn)所必需的銜接蛋白相關(guān)復(fù)合物3的δ1亞基。進(jìn)一步結(jié)果顯示,TRIB3過表達(dá)顯著減少ID1免疫沉淀物中的AP3D1蛋白豐度。研究還證實(shí),AP3D1可直接與ID1相互作用,并通過溶酶體通路加速ID1降解。TRIB3過表達(dá)可中斷HEK293T細(xì)胞中ID1與AP3D1的結(jié)合,而TRIB3敲低則增強(qiáng)NCM460細(xì)胞中ID1與AP3D1的結(jié)合。

      隨后,研究人員探索TRIB3如何破壞ID1-AP3D1結(jié)合。由于棕櫚?;瘜δ承┑鞍妆籄P3D1等銜接蛋白識別并進(jìn)行溶酶體分選十分關(guān)鍵,作者進(jìn)一步研究ID1是否發(fā)生棕櫚?;?,并以AP3D1依賴方式被遞送至溶酶體。

      去棕櫚?;敢种苿㏄almostatin B(PB)可劑量和時(shí)間依賴性下調(diào)ID1蛋白表達(dá);相反,棕櫚酰化酶抑制劑2-bromopalmitate(2-BP)產(chǎn)生相反作用。PB和2-BP還分別縮短或延長ID1半衰期。此外,PB增強(qiáng)NCM460細(xì)胞中ID1與AP3D1之間的相互作用。這些結(jié)果提示,棕櫚?;赡苁茿P3D1介導(dǎo)ID1溶酶體降解的必要條件。

      進(jìn)一步Click-iT實(shí)驗(yàn)確認(rèn),HEK293T細(xì)胞中ID1確實(shí)發(fā)生棕櫚酰化,而TRIB3過表達(dá)可顯著降低ID1棕櫚?;?。2-BP處理可消除AP3D1與ID1之間的相互作用,而且TRIB3缺失不能逆轉(zhuǎn)這一作用。同樣,在NCM460細(xì)胞中加入2-BP后,TRIB3缺失不再加速ID1降解。上述結(jié)果共同說明,TRIB3通過與ID1相互作用阻礙其棕櫚?;?,從而阻止AP3D1介導(dǎo)的識別和溶酶體降解。


      圖5:TRIB3阻礙ID1棕櫚?;瑥亩种破湓谀c上皮細(xì)胞中的溶酶體降解。a,在bafilomycin或MG132處理?xiàng)l件下,Ctrl或TRIB3KD NCM460細(xì)胞中ID1和TRIB3免疫印跡。b,通過PLA檢測TRIB3過表達(dá)對NCM460細(xì)胞中ID1與LAMP-1相互作用的影響。比例尺=5 μm。c,HEK293T細(xì)胞裂解物經(jīng)抗HA抗體免疫沉淀后進(jìn)行半定量質(zhì)譜分析(n=4個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。d,轉(zhuǎn)染ID1-HA和AP3D1-DDK的HEK293T細(xì)胞裂解物,用IgG或抗HA抗體進(jìn)行免疫沉淀。e,檢測并定量HEK293T細(xì)胞中AP3D1-DDK過表達(dá)對ID1-HA蛋白降解的影響。f,在bafilomycin處理?xiàng)l件下,檢測HEK293T細(xì)胞中TRIB3-GFP過表達(dá)對ID1-HA與AP3D1-DDK相互作用的影響。g,通過PLA檢測TRIB3過表達(dá)對NCM460細(xì)胞中ID1與AP3D1共定位的影響。比例尺=5 μm。h、i,定量分析不同劑量PB(h)或2-BP(i)處理對NCM460細(xì)胞ID1蛋白表達(dá)的影響。j,檢測并定量HEK293T細(xì)胞中PB對ID1蛋白降解的影響。k,通過PLA檢測PB對NCM460細(xì)胞中ID1與AP3D1相互作用的影響。比例尺=5 μm。l,通過Click-iT反應(yīng)檢測TRIB3過表達(dá)對ID1棕櫚酰化的影響。m,通過PLA分析所示各組NCM460細(xì)胞中ID1與AP3D1的共定位。比例尺=5 μm。n,檢測并定量2-BP對Ctrl或TRIB3KD NCM460細(xì)胞中ID1降解的影響。數(shù)據(jù)以均值±SEM表示,并采用非配對雙尾Student t檢驗(yàn)(c)、普通單因素方差分析(h和i)、Mann-Whitney U檢驗(yàn)(b)、Welch t檢驗(yàn)(g和k)以及Kruskal-Wallis檢驗(yàn)(m)進(jìn)行分析。a、d–f、h–j、l和n中n=3個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);g和m中n=10個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);b和k中n=20個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)。誤差線表示95%置信區(qū)間。圖c元素使用BioRender創(chuàng)建:shang, S. (2026) https://BioRender.com/tbfxh4l。

      巖白菜素被篩選為可上調(diào)TRIB3并抑制ID1降解的候選化合物

      上述發(fā)現(xiàn)提示,上調(diào)TRIB3可能成為IBD潛在治療策略。研究人員將TRIB3OE NCM460細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組特征輸入CMAP數(shù)據(jù)庫進(jìn)行篩選,以尋找可能上調(diào)TRIB3的化合物。結(jié)果顯示,巖白菜素、isoxsuprine、cilnidipine、JW-7-24-1和epothilone A的連接評分最高,均為99.98。

      其中,巖白菜素、isoxsuprine和cilnidipine已有細(xì)胞保護(hù)效應(yīng)報(bào)道,而JW-7-24-1和epothilone A為具有細(xì)胞殺傷活性的抗腫瘤藥物。因此,研究優(yōu)先選擇具有細(xì)胞保護(hù)性質(zhì)的化合物進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示,巖白菜素是唯一可上調(diào)NCM460細(xì)胞中TRIB3和ID1蛋白表達(dá)的化合物。

      進(jìn)一步機(jī)制研究顯示,巖白菜素上調(diào)TRIB3轉(zhuǎn)錄,但不影響TRIB3蛋白穩(wěn)定性。隨后,研究人員探索巖白菜素如何增加ID1豐度。NCM460細(xì)胞經(jīng)巖白菜素處理后,ID1棕櫚酰化顯著降低。巖白菜素還可延長ID1半衰期;這一作用可被自噬-溶酶體抑制劑bafilomycin逆轉(zhuǎn),說明巖白菜素通過抑制ID1溶酶體降解維持其蛋白穩(wěn)定性。與這一機(jī)制一致,巖白菜素還可抵消AP3D1加速ID1降解的作用。


      圖6:巖白菜素被發(fā)現(xiàn)可上調(diào)TRIB3并抑制ID1降解。a,用于篩選上調(diào)TRIB3化合物的示意圖。將TRIB3OE與Ctrl NCM460細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序獲得的差異表達(dá)基因提交至CMAP平臺,以識別可提高TRIB3水平的化合物。b,不同劑量isoxsuprine、cilnidipine和巖白菜素對NCM460細(xì)胞中TRIB3和ID1蛋白表達(dá)的影響。c,80 nM巖白菜素對NCM460細(xì)胞中ID1-DDK棕櫚酰化的影響。d,在有或無bafilomycin處理?xiàng)l件下,巖白菜素對NCM460細(xì)胞中ID1降解的影響。e,巖白菜素對AP3D1介導(dǎo)ID1降解的影響。數(shù)據(jù)以均值±SEM表示,并采用普通單因素方差分析(b和c)進(jìn)行分析。a–e中n=3個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)。誤差線表示95%置信區(qū)間。圖a元素使用BioRender創(chuàng)建:shang, S. (2026) https://BioRender.com/tbfxh4l。

      巖白菜素通過上調(diào)TRIB3恢復(fù)腸干細(xì)胞自我更新并緩解結(jié)腸炎

      巖白菜素屬于異香豆素類化合物,是傳統(tǒng)中藥巖白菜(Bergenia purpurascens)的主要活性成分之一,在中國臨床上用于慢性支氣管炎治療。既往研究報(bào)道,巖白菜素可通過調(diào)節(jié)腸道菌群或巨噬細(xì)胞活化,抑制DSS或TNBS誘導(dǎo)的小鼠或大鼠結(jié)腸炎;但其對腸干細(xì)胞自我更新的影響此前尚不清楚。

      與既往結(jié)果一致,25或50 mg/kg巖白菜素處理可減輕結(jié)腸炎小鼠體重下降、降低DAI、緩解結(jié)腸縮短、降低組織學(xué)評分并減少黏膜屏障通透性。值得注意的是,巖白菜素處理可增強(qiáng)結(jié)腸黏膜中Trib3蛋白表達(dá),促進(jìn)EdU染色提示的結(jié)腸上皮細(xì)胞增殖,并上調(diào)結(jié)腸黏膜中CBC和RSC標(biāo)志物mRNA表達(dá)。體外實(shí)驗(yàn)中,巖白菜素也增強(qiáng)了UC模型來源結(jié)腸類器官的增殖。

      隨后研究人員進(jìn)一步判斷巖白菜素是否通過上調(diào)TRIB3緩解結(jié)腸炎。結(jié)果顯示,Trib3消除會阻斷巖白菜素在UC模型中的治療作用,具體表現(xiàn)為:體重變化、DAI、結(jié)腸長度、組織學(xué)評分、血清FITC-右旋糖酐豐度以及結(jié)腸上皮細(xì)胞增殖等指標(biāo)的改善均被削弱或消失。這些數(shù)據(jù)表明,巖白菜素可通過上調(diào)TRIB3恢復(fù)腸干細(xì)胞自我更新,修復(fù)受損上皮黏膜屏障,并緩解結(jié)腸炎。

      研究還測試了巖白菜素與美沙拉嗪(Mesalazine,也稱5-ASA)聯(lián)用是否在4% DSS誘導(dǎo)的重癥UC模型中具有更好治療效果。美沙拉嗪是一種常用于輕中度IBD治療的一線藥物。從小鼠生存角度看,單獨(dú)使用美沙拉嗪或巖白菜素在急性重癥UC模型中未顯示明顯治療效果;但二者聯(lián)用明顯降低UC小鼠死亡率,從4/8降至1/8。

      與單藥治療相比,巖白菜素-美沙拉嗪聯(lián)合治療可緩解急性重癥UC小鼠體重下降、降低DAI和組織學(xué)評分。盡管該聯(lián)合治療的抗炎效果與單藥相當(dāng),但其獨(dú)特之處在于可促進(jìn)腸上皮細(xì)胞增殖并增強(qiáng)黏膜屏障完整性??傮w而言,藥理性上調(diào)TRIB3可能通過增強(qiáng)ISCs自我更新和腸黏膜屏障完整性,成為緩解IBD的一種潛在策略。


      圖7:巖白菜素通過上調(diào)TRIB3,恢復(fù)腸干細(xì)胞自我更新,修復(fù)受損上皮黏膜屏障并緩解結(jié)腸炎。a,2% DSS誘導(dǎo)UC模型中,Vehicle、25 mg/kg巖白菜素和50 mg/kg巖白菜素處理示意圖。b,小鼠DAI。c,代表性結(jié)腸大體圖像及結(jié)腸長度統(tǒng)計(jì)。d,小鼠血清FITC-右旋糖酐相對豐度。e,巖白菜素處理對結(jié)腸類器官增殖的影響(n=10個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。比例尺=200 μm。f,在Trib3IEC-KO小鼠中建立2% DSS誘導(dǎo)UC模型,并給予或不給予25 mg/kg巖白菜素處理的示意圖。g,小鼠DAI。h,小鼠血清FITC-右旋糖酐相對豐度。i,結(jié)腸組織中代表性EdU染色及統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。比例尺=20 μm。j,使用C57BL/6J小鼠建立4% DSS誘導(dǎo)急性重癥UC模型,并給予巖白菜素、美沙拉嗪或二者聯(lián)合處理的示意圖。k,小鼠死亡率。l,小鼠DAI。m,結(jié)腸組織代表性H&E染色及組織學(xué)評分統(tǒng)計(jì)。比例尺=1 mm(上圖)或50 μm(下圖)。n,結(jié)腸組織中緊密連接相關(guān)基因相對mRNA表達(dá)(Vehicle、巖白菜素和美沙拉嗪組中n=4個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn),聯(lián)合組中n=7個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn))。數(shù)據(jù)以均值±SEM表示,并采用非配對雙尾Student t檢驗(yàn)(e、h和i)、Mann-Whitney U檢驗(yàn)(g)、Kruskal-Wallis檢驗(yàn)(l)以及普通單因素方差分析(b–d、m和n)進(jìn)行分析。i和m中n=3個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);f–h中n=4個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);a–d中n=6個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn);j–l中n=8個(gè)獨(dú)立生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。所有統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)檢驗(yàn)。誤差線表示95%置信區(qū)間。圖a、f和j元素使用BioRender創(chuàng)建:shang, S. (2026) https://BioRender.com/tbfxh4l。

      貢獻(xiàn)★★★★★

      當(dāng)前IBD藥物治療的核心仍以免疫抑制為主,但這類策略存在一定局限,包括僅對部分患者有效、不良反應(yīng)較多,以及常常難以實(shí)現(xiàn)臨床意義上的黏膜愈合。因此,通過促進(jìn)腸干細(xì)胞自我更新和再生,在不依賴廣泛免疫抑制的情況下實(shí)現(xiàn)黏膜愈合,是一種具有吸引力的治療思路。

      本研究基于臨床膽汁酸代謝組學(xué)線索,聚焦IBD患者糞便中升高的結(jié)合型膽汁酸GCA。結(jié)果顯示,GCA可通過減少RSC數(shù)量、抑制CBC增殖能力,破壞腸黏膜屏障并加重UC。機(jī)制上,GCA抑制腸道TRIB3-ID1軸,削弱腸干細(xì)胞自我更新。TRIB3可與ID1相互作用,抑制其棕櫚?;癆P3D1介導(dǎo)的溶酶體分選和降解,從而維持腸干細(xì)胞干性并促進(jìn)黏膜愈合。

      研究還提示,膽汁酸對腸干細(xì)胞功能具有重要調(diào)節(jié)作用。在IBD條件下,膽汁酸穩(wěn)態(tài)紊亂通常表現(xiàn)為宿主來源初級膽汁酸升高、菌群來源次級膽汁酸降低。既往研究提示,次級膽汁酸LCA和脫氧膽酸(DCA)在生理濃度下可增強(qiáng)腸類器官出芽并改善干細(xì)胞功能,而初級膽汁酸CA可通過抑制PPARα介導(dǎo)的脂肪酸β氧化觸發(fā)Lgr5+ ISC功能障礙。本研究進(jìn)一步將GCA確定為另一種可同時(shí)破壞RSC和CBC的初級膽汁酸,豐富了IBD中膽汁酸與腸干細(xì)胞關(guān)系的認(rèn)識。

      此外,本研究將GCA整合進(jìn)DSS誘導(dǎo)的小鼠結(jié)腸炎模型,有助于更好模擬人類IBD中膽汁酸代謝紊亂的病理背景。作者還指出,新近發(fā)現(xiàn)的微生物結(jié)合型膽汁酸,如色氨酸結(jié)合膽酸和GABA-膽汁酸雜合物,可能構(gòu)成宿主-微生物互作的新層次。未來需要進(jìn)一步探索這些新型微生物膽汁酸結(jié)合物是否也會影響TRIB3-ID1軸,從而調(diào)控腸屏障完整性和炎癥消退。

      從治療角度看,本研究提出,上調(diào)TRIB3可能成為促進(jìn)IBD黏膜愈合的一種潛在策略。TRIB3在不同病理生理背景下可通過不同機(jī)制維持細(xì)胞干性:在結(jié)直腸癌干細(xì)胞中,它可與β-catenin相互作用并激活Wnt信號;在健康腸干細(xì)胞中,它則與ID1相互作用并增強(qiáng)ID1蛋白穩(wěn)定性。這說明同一蛋白在不同疾病背景下具有功能靈活性。

      需要注意的是,包括TRIB3、ID1、YAP、STAT3和STAT5在內(nèi)的一系列干性調(diào)節(jié)因子,可能對疾病產(chǎn)生雙向影響:一方面支持腸黏膜修復(fù)、減輕IBD嚴(yán)重程度;另一方面也可能在某些背景下促進(jìn)結(jié)直腸癌進(jìn)展。因此,未來若將這類分子作為IBD治療靶點(diǎn),需要謹(jǐn)慎控制其在腸上皮細(xì)胞中的上調(diào)程度,以降低潛在腫瘤風(fēng)險(xiǎn)。

      本研究還發(fā)現(xiàn),巖白菜素可通過上調(diào)TRIB3增強(qiáng)美沙拉嗪在重癥UC模型中的治療效果,這可能拓展5-ASA類藥物在輕中度UC之外的治療應(yīng)用空間。既往研究認(rèn)為巖白菜素可通過抑制巨噬細(xì)胞活化緩解UC,而本研究顯示,腸道Trib3敲除幾乎消除了巖白菜素抗IBD作用,提示其關(guān)鍵作用可能來自對腸上皮和腸干細(xì)胞再生的調(diào)節(jié)。在IBD中,腸上皮細(xì)胞與免疫細(xì)胞之間存在復(fù)雜交互:過度激活的促炎免疫細(xì)胞可破壞上皮屏障,而腸上皮細(xì)胞也可通過分泌免疫調(diào)節(jié)因子反向調(diào)控免疫細(xì)胞表型。因此,巖白菜素也可能通過恢復(fù)腸干細(xì)胞再生和上皮修復(fù),間接調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞促炎表型。

      總體而言,本研究闡明了膽汁酸代謝紊亂與IBD進(jìn)展之間此前未被充分認(rèn)識的機(jī)制聯(lián)系,并提供了一個(gè)原則性證據(jù):通過上調(diào)TRIB3表達(dá)、增強(qiáng)ID1穩(wěn)定性,可能恢復(fù)腸干細(xì)胞干性并促進(jìn)IBD黏膜愈合。

      不過,研究也存在一定局限。首先,GCA-TRIB3-ID1軸的臨床相關(guān)性仍需進(jìn)一步驗(yàn)證,尤其是GCA代謝紊亂患者是否會成為TRIB3靶向治療的主要獲益人群,目前尚不明確。未來需要在定義清晰的臨床隊(duì)列中進(jìn)一步驗(yàn)證。其次,巖白菜素作為先導(dǎo)化合物仍缺乏系統(tǒng)藥理學(xué)特征分析。其藥代動力學(xué)性質(zhì)、構(gòu)效關(guān)系和毒理學(xué)特征仍需深入評估,才能判斷其進(jìn)一步轉(zhuǎn)化潛力。

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