各種AI大模型、上億融資、BD新聞刷屏,MNC在用錢投票,鬧得不亦熱乎~今天的 AI制藥 已不是能不能行的問題,而是誰先跑到終點!
但很多人心里還是打鼓: AI找到分子、靶點,到底能不能成藥?
這不能靠理論回答,得看具體東西。
今天這篇胖貓選了眼下最受捧的AI藥物管線,從早期靶點發現,到臨床II期、III期數據,看看啥情況。
見微知著,通過這幾條管線感知這波AI制藥浪潮到底是真命題還是一陣風!
01
Zasocitinib,即將沖線上市
Nimbus Therapeutics加Schr?dinger再加武田上演了AI技術的三英戰呂布!用到的AI技術是大規模自由能擾動(Free Energy Perturbation, FEP+)
管線設計邏輯基于計算化學,同時加上AI加速的苗頭化合物優化。
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靶點就是我們耳熟能詳的。
JAK家族四個激酶TYK2、、JAK2和JAK3的催化域結構高度相似,激酶抑制的選擇性是個大難題。
Nimbus和Schr?dinger用大規模基于物理的模擬(特別是FEP+)克服了JAK家族內序列相似性帶來的選擇性挑戰。
先用FEP+預測藥物TYK2的靶向活性及對JAK2和JAK3的脫靶活性。再引入絕對FEP+預測水溶性,在建模早期解決ADME問題。
團隊對預篩的4000個候選分子進行了大規模FEP+評分,評估其效力、選擇性和溶解度,并將FEP+部署到云計算資源。
最終,基于FEP+計算,46個分子被優先合成,其中9個在實驗測試中符合標準。最終開發出一種靶向TYK2 JH1結構域的候選藥物,該藥物對JAK2具有高度選擇性,對JAK1和JAK3具有中等選擇性。
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團隊用AI輔助的分子設計引擎快速生成、評估、淘汰龐大的虛擬化合物庫,主要技術指標有三項: 1)皮摩爾級親和力; 2)對JAK1/2/3幾乎無選擇性; 3)良好的溶解性;
在傳統藥化解決方案下要滿足三者需要數年時間,但FEP+把這個時間壓縮到了數月。
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從臨床結果看,Zasocitinib治療中重度斑塊狀銀屑病成人患者的兩項關鍵性III期隨機、多中心、雙盲、安慰劑和活性對照研究取得了積極的頂線結果。
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值得一提的是,這個產品早就被武田以40億首付款買走了!
對的,你沒看錯,算是幾年來說,Big pharma BD交易,首付款金額之最了!
02
GB-0895,生成式AI設計的抗體
Generate Biomedicines的自研生成式編程生物學平臺
傳統抗體篩選靠的是噬菌體展示或雜交瘤技術,從抗體庫里撈序列。
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Generate從臨床的問題出發,AI直接生成目標抗體序列。 平臺運行邏輯是一個閉環:生成(Generate)→ 構建(Build)→ 測量(Measure)→ 學習(Learn)。
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GB-0895是靶向TSLP的抗體。
通過AI鎖定表位,選擇合適親和力抗體。AI識別的恰好是TSLP與受體結合的關鍵區域,阻止信號傳導的效率遠超傳統抗體。
再通過AI預測Fc區改造方案,延長抗體體內的循環時間,實現半年給藥一次。
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03
Zovegalisib,基于蛋白運動軌跡的別構抑制劑
Relay Therapeutics利用分子動態學 + 低溫電子顯微鏡 + 變構口袋發現
Relay的技術哲學很獨特,蛋白質不是靜態的,它們在持續運動。
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他們用Cryo-EM解析了PI3Kα全長結構,包括野生和多種突變體型(H1047X、E542X、E545X)。
通過分子動態模擬發現了傳統X射線晶體學從未揭示的隱性變構口袋,這個口袋 只在突變體 蛋白運動過程中短暫出現,野生型則幾乎沒有。
這就是Zovegalisib的設計出發點,不去搶ATP結合位(那是所有已上市PI3K抑制劑的戰場),而是打突變體專屬變構口袋。
結果顯示RLY-2608對突變PI3Kα的抑制活性比野生型高出數十倍,實現了真正的選擇性打擊,正常細胞幾乎不受影響。
繞開了傳統PI3K抑制劑的血糖紊亂等嚴重副作用。
從臨床結果看, Zovegalisib在PI3Kα突變驅動的乳腺癌和血管畸形中療效顯著優于現有標準治療,有潛力成為這些適應癥的BIC(Best-in-Class)藥物。
2026年底將有多項注冊里程碑,2027年初啟動一線乳腺癌關鍵試驗。
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04
REC-4881,AI表型篩選 + 基因-疾病關聯預測
Recursion(Morphology DevMap、MapData)的高通量細胞形態學圖譜(Morphological Phenotyping)+ 因果推理模型
Recursion與其它AI制藥公司不同,核心平臺是形態學圖譜。
用顯微鏡對數百萬個細胞進行成像,每個細胞提取一千多種形態特征(細胞核面積、線粒體形狀、突觸分布……),建立正常細胞與疾病模型細胞的視覺指紋庫。
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對REC-4881,Recursion建立了APC基因敲低的疾病模型。
APC突變是家族性腺瘤性息肉病FAP的致病原因,患者腸道細胞失去了調控β-catenin降解的能力,導致Wnt通路持續激活,息肉瘋狂生長。
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AI在數千個化合物庫中篩選哪一個分子能讓APC突變細胞的形態回歸正常,最終發現MEK1/2抑制劑有這個效果!
這是一個完全由AI預測驅動發現的靶點。
隨后Recursion用因果推理模型深入研究MEK抑制→下游通路下調→β-catenin信號正常化→息肉減少。解釋了REC-4881在FAP患者中產生效果的底層機制。
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所以REC-4881的創新不在分子本身(這產品從武田license in的),而在于AI找到了它在FAP適應癥上的新用途,實現了老藥新用+精準匹配。
REC-4881目前處于Phase 1b/2, 安全性上不良事件多為 1/2 級(痤瘡樣皮炎、CPK 升高、皮疹),3 級發生率低,無 4/5 級,安全性可控。
有效性方面 ,4 mg組給藥 12 周后大多患者息肉明顯減少,停藥12周后仍維持效果。
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05
總結
這幾家公司最快的是Zasocitinib(武田/Nimbus),其次是GB-0895和Zovegalisib的III期管線。
見微知著,背后是十幾家公司的不同解題思路。技術路線沒有絕對優劣,靶點、分子、資金、執行,缺一不可。
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