百濟(jì)神州領(lǐng)銜，逾20家補(bǔ)稅超16億！醫(yī)藥行業(yè)正在經(jīng)歷一場"大清算"

6月26日，百濟(jì)神州子公司補(bǔ)稅4.46億元的消息，引爆醫(yī)藥市場。

一場稅務(wù)風(fēng)波，由此被牽出。

年初中國醫(yī)藥、重藥控股多次深陷補(bǔ)稅風(fēng)波，隨后連續(xù)虧損4年的藍(lán)帆醫(yī)療、虧損5年艾迪藥業(yè)也被爆出補(bǔ)稅，再到近期的歐林生物、苑東生物、華邦健康，幾乎是席卷整個行業(yè)。

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，2026上半年，就有20家醫(yī)藥公司披露補(bǔ)稅公告，累計(jì)金額達(dá)到16億元。如果按月份來看，6月份補(bǔ)稅金額最高，5家企業(yè)補(bǔ)稅總額超6億元。1月份涉及企業(yè)最多，達(dá)到7家，補(bǔ)稅金額3.9億。

這背后最值得關(guān)注的是政策信號：

1月1日，國家稅務(wù)總局發(fā)布了2號公告《國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅一般納稅人登記管理有關(guān)事項(xiàng)的公告》，讓補(bǔ)稅成本直接飆升了十幾倍；

6月8日，國家衛(wèi)生健康委等14部門聯(lián)合印發(fā)《2026年糾正醫(yī)藥購銷領(lǐng)域和醫(yī)療服務(wù)中不正之風(fēng)工作要點(diǎn)》，首次將稅收問題單獨(dú)列為一條重點(diǎn)工作，與醫(yī)保基金安全、行業(yè)購銷秩序并列。

醫(yī)療反腐之下，稅務(wù)合規(guī)正成為2026年新的戰(zhàn)場。

01、4.46億！“天價(jià)”補(bǔ)稅

一則補(bǔ)稅務(wù)公告，“引爆”市場關(guān)注。

6月26日，百濟(jì)神州公告稱，據(jù)主管稅務(wù)部門對相關(guān)稅務(wù)事項(xiàng)的通知，一家境內(nèi)全資子公司需補(bǔ)繳稅款及滯納金共計(jì)約4.46億元。

補(bǔ)稅金額相對較高，僅次于愛爾眼科的5.24億元，引發(fā)關(guān)注。

按金額估算4.46億元補(bǔ)稅金額相當(dāng)于百濟(jì)神州2026年一個月的利潤規(guī)模。2026年Q1，百濟(jì)神州營收達(dá)105.44億元，同比增長31%。凈利潤16.08億元，補(bǔ)稅約占其27.7%。

有意思的是，對于此次處罰的原因，百濟(jì)神州公告沒有說補(bǔ)稅原因，也沒有說補(bǔ)的什么稅，更沒有說是哪家子公司，哪里的稅局檢查，只提及補(bǔ)稅金額。

不過，百濟(jì)神州公告明確兩點(diǎn)：“不涉處罰，不溯過往”。

其一，本次事項(xiàng)不涉及行政處罰；其二，公司經(jīng)審慎判斷，根據(jù)《企業(yè)會計(jì)準(zhǔn)則第28號——會計(jì)政策、會計(jì)估計(jì)變更和差錯更正》相關(guān)規(guī)定，該事項(xiàng)不屬于前期會計(jì)差錯，不涉及前期財(cái)務(wù)數(shù)據(jù)追溯調(diào)整。

這一公告算是給市場吃了一顆“定心丸”。相關(guān)稅務(wù)專業(yè)人士對記者指出，這一區(qū)分對百濟(jì)神州意義重大。若被認(rèn)定為前期會計(jì)差錯，意味著以往財(cái)報(bào)數(shù)據(jù)需要“回爐重造”，可能動搖投資者對財(cái)務(wù)信息可信度的判斷。百濟(jì)神州此番明確排除這一情形，在一定程度上有助于穩(wěn)定市場預(yù)期。

補(bǔ)稅風(fēng)波之下，連帶著其6月12日董事會換屆，再次讓百濟(jì)神州成為市場“熱點(diǎn)”。高領(lǐng)資本的“退出”就是重點(diǎn)其一，截至2025年底，百濟(jì)神州的前十大股東中已無高瓴相關(guān)投資主體出現(xiàn)，而其第十大股東的持股比例為0.11%。6月12日的董事會換屆，高瓴資本合伙人易諾青退出董事會，似乎意味著高瓴已接近“清倉”百濟(jì)神州。

02、20家藥企補(bǔ)稅，超16億元

百濟(jì)神州此番補(bǔ)稅并非個案。

據(jù)不完全統(tǒng)計(jì)，2026上半年，已有近70家上市公司披露了補(bǔ)稅相關(guān)信息，其中醫(yī)藥是“重災(zāi)區(qū)”，有20家藥企爆出補(bǔ)稅消息，累計(jì)達(dá)到16億元。

按月份來看，6月份補(bǔ)稅金額最高，超6億元。1月份涉及企業(yè)最多，達(dá)到7家，金額3.9億。

6月份總共有5家企業(yè)補(bǔ)稅，除開百濟(jì)神州最近的是歐林生物，其一邊補(bǔ)繳稅款，一邊繳納滯納金，總共達(dá)8740.80萬元。

6月22日，公司收到稅務(wù)部門出具的《稅務(wù)處理決定書》，根據(jù)相關(guān)文書，公司已于2025年預(yù)補(bǔ)繳稅款420.01萬元，本次應(yīng)補(bǔ)繳8,320.79萬元，占公司最近一個會計(jì)年度經(jīng)審計(jì)營業(yè)收入的11.82%。

苑東生物則是受累于子公司，罰款高達(dá)428.96萬元

6月18日，苑東生物子公司西藏潤禾收到國家稅務(wù)總局西藏自治區(qū)稅務(wù)局稽查局下發(fā)的《稅務(wù)行政處罰事項(xiàng)告知書》：擬認(rèn)定西藏潤禾在2017年至2021年期間取得上游服務(wù)商虛開及作廢發(fā)票，應(yīng)補(bǔ)繳企業(yè)所得稅857.91萬元，并處以罰款428.96萬元，同時對上述少繳稅款從滯納之日起按日加收萬分之五的滯納金。

華邦健康則是三項(xiàng)疊加，總額7678.35萬元。

6月17日，國家稅務(wù)總局沈陽市稅務(wù)局第二稽查局要求華邦健康全資子公司新馬藥業(yè)，作出補(bǔ)繳2019-2024年企業(yè)所得稅合計(jì)為3343.33萬元、增值稅及附加稅合計(jì)為507.16萬元，罰款合計(jì)為3827.86萬元的稅務(wù)處理，共計(jì)7678.35萬元。

而1月共有7家，最受關(guān)注的是藍(lán)帆醫(yī)療、艾迪藥業(yè)。藍(lán)帆醫(yī)療已連續(xù)四年虧損，艾迪藥業(yè)自上市后已經(jīng)連續(xù)5年虧損。

1月31日，藍(lán)帆醫(yī)療發(fā)布公告，公司及子公司根據(jù)稅務(wù)部門要求，對健康防護(hù)事業(yè)部相關(guān)主體在2020至2022年度的跨境關(guān)聯(lián)交易開展特別納稅調(diào)整自查，需補(bǔ)繳稅款及利息合計(jì)約1.96億元。其中，稅款本金為1.6956億元，其余為加收利息。

1月25日，根據(jù)揚(yáng)州市稅務(wù)部門的通知，艾迪藥業(yè)需補(bǔ)繳稅款共計(jì)約1995.20萬元。本次補(bǔ)繳稅款不涉及滯納金，不涉及行政處罰。

另外，中國醫(yī)藥、重藥控股多次陷入“補(bǔ)稅”風(fēng)波。

1月1日，中國醫(yī)藥表示：下屬三洋藥業(yè)需補(bǔ)繳稅款2,148.62萬元，滯納金約1,074.29萬元；康力藥業(yè)需補(bǔ)繳稅款2,128.26萬元，滯納金約1,170.61萬元。合計(jì)需補(bǔ)繳稅款及滯納金約6,521.78萬元。此前2023年10月，中國醫(yī)藥發(fā)布公告，海南通用三洋藥業(yè)補(bǔ)繳稅款及滯納金合計(jì)9687.37萬元。

1月22日，重藥控股7家子公司補(bǔ)稅3221.03萬。早在2025年11月27日，重藥控股22家子公司就補(bǔ)稅4430.26萬

此外還有，浙江震元自查補(bǔ)稅389.51萬、冠昊生物補(bǔ)稅1,729.81萬、金陵藥業(yè)補(bǔ)稅841.15萬、康美藥業(yè)補(bǔ)稅413.6萬......涉及關(guān)聯(lián)交易定價(jià)、虛開發(fā)票等，醫(yī)藥行業(yè)稅務(wù)風(fēng)險(xiǎn)正在以前所未有的爆發(fā)的態(tài)勢浮出水面。

03、補(bǔ)稅潮的背后

2026年，藥企補(bǔ)稅最大特點(diǎn)是“自查補(bǔ)繳”，占比超過50%。政策監(jiān)管以及懲罰力度的加大，是一眾藥企主動“自查補(bǔ)繳”的原因之一。

1月1日，國稅總局發(fā)布了2號公告《國家稅務(wù)總局關(guān)于增值稅一般納稅人登記管理有關(guān)事項(xiàng)的公告》成為年初補(bǔ)稅的導(dǎo)火索。簡單理解就是：以前被查出來，可能只需要按1%的征收率補(bǔ)稅；現(xiàn)在一旦被追溯認(rèn)定為一般納稅人，就要按13%的稅率補(bǔ)繳，補(bǔ)稅成本直接飆升了十幾倍。

6月8日，國家衛(wèi)生健康委等14部門聯(lián)合印發(fā)《2026年糾正醫(yī)藥購銷領(lǐng)域和醫(yī)療服務(wù)中不正之風(fēng)工作要點(diǎn)》，首次將稅收問題單獨(dú)列為一條重點(diǎn)工作，與醫(yī)保基金安全、行業(yè)購銷秩序并列。

文件提及2核心點(diǎn)：其一點(diǎn)名行業(yè)內(nèi)常見的高值耗材變票、二手設(shè)備翻新開票、虛開推廣費(fèi)/咨詢費(fèi)套取資金用于帶金銷售等操作；其二提及CSO銷售服務(wù)公司，成為虛開發(fā)票的主要載體，未來將面臨0.5-5倍罰款。

此外，醫(yī)藥補(bǔ)稅公告還有一個共同特征：追溯期長

按照目前披露的數(shù)據(jù)來看，稅務(wù)倒查集中在3-6年。珍寶島子公司被認(rèn)定補(bǔ)繳2019年至2024年的六年稅款；藍(lán)帆醫(yī)療被追溯2020-2022年度跨境關(guān)聯(lián)交易問題，追溯整整6年的賬。

有相關(guān)人士回應(yīng)：“針對因計(jì)算錯誤、非主觀故意導(dǎo)致的少繳稅款，法律規(guī)定的追征期通常為3年；涉及金額較大的，延長至5年。”這也是為何近期的自查提示多集中在2022-2025年。

這從另一個層面，斷絕了企業(yè)僥幸的可能。而2026年，在稅務(wù)強(qiáng)監(jiān)管之下，沒有一家藥企能置身事外。