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      Int J Biol Sci I 靶向CPT1A,誘導(dǎo)肝星狀細(xì)胞鐵死亡:茜草天然產(chǎn)物Rubimaillin破解肝纖維化新機(jī)制!(尹航/蔣云瑤/徐英-清華...

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      2026年1月22日,清華大學(xué)藥學(xué)院/膜生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室尹航蔣云瑤團(tuán)隊(duì)聯(lián)合上海中醫(yī)藥大學(xué)徐英團(tuán)隊(duì)、上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬曙光醫(yī)院等,在International Journal of Biological Sciences中科院1區(qū),IF=10.0)在線發(fā)表題為 “Rubimaillin ameliorates liver fibrosis by triggering the ferroptosis of activated hepatic stellate cells through targeting CPT1A” 的研究論文。該研究聚焦肝纖維化進(jìn)展中活化肝星狀細(xì)胞(HSCs)鐵死亡不足與代謝重編程異常這一關(guān)鍵問(wèn)題,首次系統(tǒng)揭示中藥茜草來(lái)源天然產(chǎn)物 Rubimaillin(Rub)可直接靶向 CPT1A,誘導(dǎo)活化 HSCs 發(fā)生鐵死亡,從而顯著改善肝損傷與肝纖維化,為肝纖維化治療提供了新的天然產(chǎn)物候選物和潛在分子靶點(diǎn)。


      編者按:

      肝纖維化是多種慢性肝病向肝硬化、肝衰竭甚至肝癌進(jìn)展的共同病理基礎(chǔ),其核心特征是細(xì)胞外基質(zhì)異常沉積和肝臟結(jié)構(gòu)破壞。目前臨床上針對(duì)肝纖維化仍缺乏獲批的特異性抗纖維化藥物,治療主要依賴病因控制,如抗病毒、戒酒、減重和改善代謝紊亂等。因此,尋找能夠直接干預(yù)纖維化進(jìn)程的新靶點(diǎn)和新藥物具有重要意義。

      肝星狀細(xì)胞是肝纖維化發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵效應(yīng)細(xì)胞。正常情況下,HSCs處于靜息狀態(tài),主要負(fù)責(zé)儲(chǔ)存維生素A;當(dāng)肝臟長(zhǎng)期受損時(shí),HSCs被激活并轉(zhuǎn)化為肌成纖維細(xì)胞樣細(xì)胞,表現(xiàn)出增強(qiáng)的增殖、遷移、收縮和細(xì)胞外基質(zhì)分泌能力。近年來(lái)研究表明,誘導(dǎo)活化HSCs發(fā)生鐵死亡,可以抑制其異常增殖和膠原沉積,被認(rèn)為是抗肝纖維化的重要策略。與此同時(shí),CPT1A作為脂肪酸氧化的限速酶,參與細(xì)胞能量代謝重編程,并與HSCs活化和鐵死亡抵抗密切相關(guān),因此具有重要的治療靶點(diǎn)價(jià)值。

      本研究中,作者首先在TGF-β1誘導(dǎo)的LX2和JS1細(xì)胞模型中發(fā)現(xiàn),Rub可濃度依賴性抑制HSCs活化,降低α-SMA、Col1A1等纖維化標(biāo)志物表達(dá)。隨后,在CCl4誘導(dǎo)的小鼠肝纖維化模型中,Rub顯著降低血清ALT、AST水平,改善肝組織病理?yè)p傷,減少M(fèi)asson和Sirius red染色所示的膠原沉積,并降低α-SMA、Col1A1、Col3A1和TGF-β1等纖維化相關(guān)指標(biāo),提示Rub具有明確的抗肝損傷和抗纖維化作用。

      為進(jìn)一步解析其機(jī)制,研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)RNA-seq發(fā)現(xiàn)Rub處理后谷胱甘肽代謝和鐵死亡通路顯著富集,提示鐵死亡可能是Rub抗肝纖維化的核心機(jī)制。后續(xù)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí),Rub可增強(qiáng)活化HSCs中ACSL4表達(dá),降低GPX4水平,并引起GSH減少、GSSG升高、脂質(zhì)過(guò)氧化、ROS和Fe2?積累,以及線粒體縮小、嵴減少等典型鐵死亡特征。值得注意的是,Rub主要誘導(dǎo)活化HSCs鐵死亡,而對(duì)肝細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和肝竇內(nèi)皮細(xì)胞的鐵死亡影響相對(duì)有限,體現(xiàn)出一定的細(xì)胞選擇性。

      在靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)方面,作者利用PROTAC靶點(diǎn)捕獲技術(shù)篩選Rub的直接作用蛋白,并將CPT1A確定為關(guān)鍵候選靶點(diǎn)。進(jìn)一步通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬、CETSA、DARTS、BLI和位點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)證實(shí),Rub可直接結(jié)合CPT1A,并通過(guò)SER592、THR594和THR689等關(guān)鍵位點(diǎn)抑制CPT1A活性。CPT1A敲低或過(guò)表達(dá)均可削弱Rub誘導(dǎo)HSCs鐵死亡的作用,說(shuō)明CPT1A是Rub發(fā)揮抗纖維化效應(yīng)的關(guān)鍵靶點(diǎn)。

      機(jī)制上,Rub通過(guò)靶向CPT1A調(diào)控c-Myc泛素化,進(jìn)而影響NRF2/GPX4抗氧化系統(tǒng)和ACSL4/PL-PUFAs脂質(zhì)過(guò)氧化通路,最終推動(dòng)活化HSCs發(fā)生代謝重編程介導(dǎo)的鐵死亡。換言之,Rub并非單純抑制HSCs活化,而是通過(guò)“靶向CPT1A—重塑脂肪酸代謝—削弱抗氧化防御—增強(qiáng)脂質(zhì)過(guò)氧化—誘導(dǎo)鐵死亡”這一連續(xù)機(jī)制,從源頭上限制纖維化效應(yīng)細(xì)胞的病理功能。

      綜上,該研究不僅闡明了Rubimaillin抗肝纖維化的藥效基礎(chǔ),還揭示了其直接靶點(diǎn)CPT1A及其介導(dǎo)的鐵死亡調(diào)控機(jī)制。該發(fā)現(xiàn)拓展了天然產(chǎn)物干預(yù)肝纖維化的研究思路,也為“靶向活化HSCs鐵死亡”這一治療策略提供了新的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。未來(lái),若能在HSCs特異性CPT1A敲除動(dòng)物模型和更接近臨床病因的肝纖維化模型中進(jìn)一步驗(yàn)證,將有望推動(dòng)Rub及CPT1A靶向策略向抗肝纖維化藥物開(kāi)發(fā)邁進(jìn)。

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      代謝與整合生物學(xué)微信公眾號(hào)_20260516-2.pdf

      摘要

      肝纖維化是指由于慢性肝損傷導(dǎo)致細(xì)胞外基質(zhì)蛋白在肝臟中過(guò)度積累。靶向誘導(dǎo)活化肝星狀細(xì)胞(hepatic stellate cells, HSCs)發(fā)生鐵死亡,被認(rèn)為是治療肝纖維化的一種有前景的策略。Rubimaillin(Rub)是從傳統(tǒng)中藥茜草(Rubia cordifolia L.)中提取的一種萘醌類化合物,在多種疾病中表現(xiàn)出多樣的藥理活性。本研究旨在探討 Rub 的抗肝纖維化作用、直接蛋白靶點(diǎn)及其分子機(jī)制。

      研究結(jié)果表明,在小鼠模型中,Rub 可通過(guò)觸發(fā)活化 HSCs 的鐵死亡,有效改善肝纖維化。隨后,研究者利用 PROTAC 技術(shù)、計(jì)算機(jī)分子動(dòng)力學(xué)模擬、細(xì)胞熱轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)(CETSA)、藥物親和反應(yīng)靶標(biāo)穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)(DARTS)、生物層干涉技術(shù)(BLI)以及位點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn),證實(shí) Rub 可直接結(jié)合肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶 1A(CPT1A)的 SER592、THR594 和 THR689 位點(diǎn),并抑制其活性。

      進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),在活化 HSCs 中抑制或缺失 CPT1A 可觸發(fā)由代謝重編程介導(dǎo)的鐵死亡。此外,CPT1A 缺失或過(guò)表達(dá)均可消除 Rub 誘導(dǎo)鐵死亡的作用。從機(jī)制上看,Rub 誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡與其靶向 CPT1A 所介導(dǎo)的代謝重編程有關(guān)。綜上,本研究闡明了 Rub 通過(guò)誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡改善肝纖維化的有益作用、直接蛋白靶點(diǎn)及分子機(jī)制。

      關(guān)鍵詞:Rubimaillin;肝纖維化;肝星狀細(xì)胞(HSCs);鐵死亡;肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶 1A(CPT1A)。


      01

      研究背景及科學(xué)問(wèn)題

      肝纖維化是多種慢性肝病進(jìn)展過(guò)程中的關(guān)鍵共同病理過(guò)程。當(dāng)肝臟持續(xù)受到損傷,例如受到慢性病毒性肝炎(乙型肝炎和丙型肝炎)、酒精性肝病、代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝病(MAFLD)、自身免疫性肝病等致病因素刺激時(shí),肝星狀細(xì)胞(HSCs)被激活,細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)成分的合成增加而降解減少。隨后,大量 ECM 在肝組織中異常沉積,逐漸破壞肝臟正常結(jié)構(gòu),并使肝臟質(zhì)地變硬,從而形成肝纖維化。

      隨著生活方式改變,酒精性肝病和 MAFLD 的發(fā)生率急劇上升,再加上慢性病毒性肝炎的持續(xù)影響,肝纖維化患病率逐年增加。然而,肝纖維化領(lǐng)域仍存在未被滿足的臨床需求,目前尚無(wú)獲批用于其治療的特異性化學(xué)藥物或生物制劑。現(xiàn)階段主要治療方式仍是病因治療,例如慢性病毒性肝炎患者接受抗病毒治療,酒精性肝病患者戒酒,MAFLD 患者控制體重并改善代謝紊亂。鑒于現(xiàn)有治療手段的局限性以及肝纖維化形勢(shì)日益嚴(yán)峻,亟需尋找新的治療靶點(diǎn)和候選藥物。

      肝纖維化的發(fā)生并非由單一因素導(dǎo)致,而是多種細(xì)胞類型、信號(hào)通路和細(xì)胞外環(huán)境相互交織并協(xié)同作用的結(jié)果。普遍認(rèn)為,HSCs 是肝纖維化中的主要效應(yīng)細(xì)胞,其活化是肝纖維化發(fā)病機(jī)制中的核心事件。在正常肝臟中,HSCs 處于靜息狀態(tài),主要功能是儲(chǔ)存維生素 A 并維持肝臟正常結(jié)構(gòu)。然而,當(dāng)肝臟遭受持續(xù)損傷時(shí),多種刺激信號(hào)會(huì)破壞 HSCs 穩(wěn)態(tài),促使其轉(zhuǎn)化為肌成纖維細(xì)胞樣細(xì)胞。活化后的 HSCs 獲得了較強(qiáng)的增殖和遷移能力、收縮特性以及分泌細(xì)胞因子和 ECM 的能力。值得注意的是,HSCs 的增殖和遷移需要大量能量輸入,從而觸發(fā)細(xì)胞代謝重編程。

      肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶 1A(CPT1A)是一種位于線粒體外膜的酶,可通過(guò)將長(zhǎng)鏈脂肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)至線粒體進(jìn)行 β-氧化來(lái)構(gòu)成脂肪酸氧化的限速步驟,并以 ATP 形式產(chǎn)生能量,在調(diào)控細(xì)胞能量代謝中發(fā)揮重要作用。此外,CPT1A 介導(dǎo)的脂肪酸氧化可通過(guò)核苷代謝促進(jìn)鼻咽癌細(xì)胞增殖。已有研究證實(shí),在肝纖維化小鼠模型和肝纖維化患者的 HSCs 中,CPT1A 表達(dá)顯著升高;升高的 CPT1A 可誘導(dǎo) HSCs 活化,從而促進(jìn)肝纖維化進(jìn)展。相反,在 HSCs 中通過(guò)藥理或遺傳方式抑制 CPT1A,可通過(guò)抑制 HSCs 活化來(lái)緩解肝纖維化。因此,開(kāi)發(fā)靶向 CPT1A 的化合物可能為肝纖維化治療開(kāi)辟新的途徑。

      鐵死亡作為一種新型程序性細(xì)胞死亡方式,近年來(lái)在肝纖維化研究領(lǐng)域受到廣泛關(guān)注。與傳統(tǒng)的細(xì)胞凋亡和壞死不同,鐵死亡主要依賴鐵過(guò)載和脂質(zhì)過(guò)氧化物積累,進(jìn)而破壞細(xì)胞膜結(jié)構(gòu)并觸發(fā)細(xì)胞死亡。多項(xiàng)研究表明,在肝纖維化過(guò)程中,細(xì)胞內(nèi)鐵代謝失衡、鐵離子攝取增加以及儲(chǔ)存和輸出減少,會(huì)導(dǎo)致 HSCs 鐵過(guò)載,并為鐵死亡發(fā)生提供條件。研究證實(shí),誘導(dǎo)活化 HSCs 發(fā)生鐵死亡可顯著降低 HSCs 生長(zhǎng)、抑制 ECM 積累,從而緩解肝纖維化。因此,誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡正成為一種新的、有前景的肝纖維化治療策略。

      目前,CPT1A 被認(rèn)為是鐵死亡抵抗的重要驅(qū)動(dòng)因子,阻斷 CPT1A 可觸發(fā)鐵死亡。近期研究表明,靶向 CPT1A 介導(dǎo)的代謝重編程可通過(guò)兩種關(guān)鍵機(jī)制誘導(dǎo)鐵死亡:一是下調(diào)核因子 E2 相關(guān)因子 2(NRF2)/谷胱甘肽過(guò)氧化物酶 4(GPX4)抗氧化系統(tǒng);二是增強(qiáng)長(zhǎng)鏈酰基輔酶 A 合成酶 4(ACSL4)介導(dǎo)的磷脂多不飽和脂肪酸(PL-PUFAs)生成,而這兩者均受 c-Myc 泛素化調(diào)控。因此,考慮到 CPT1A 在活化 HSCs 以及鐵死亡中的作用,作者推測(cè) CPT1A 也可能通過(guò)介導(dǎo)代謝重塑來(lái)誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡,從而緩解肝纖維化。簡(jiǎn)言之,靶向 CPT1A 介導(dǎo)的活化 HSCs 鐵死亡具有成為肝纖維化治療策略的潛力。

      目前,針對(duì)中藥成分和天然產(chǎn)物的靶標(biāo)捕獲技術(shù)已有多種。親和力基礎(chǔ)靶標(biāo)鑒定可通過(guò)小分子與蛋白之間的固有親和力捕獲靶標(biāo),操作簡(jiǎn)便,但容易受到非特異性結(jié)合事件的干擾;活性基礎(chǔ)蛋白質(zhì)組學(xué)分析(ABPP)通過(guò)活性探針實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白活性位點(diǎn)的特異性結(jié)合,適用于酶類靶標(biāo),但應(yīng)用范圍受限;無(wú)標(biāo)記靶標(biāo)鑒定可避免標(biāo)簽干擾并重現(xiàn)靶標(biāo)的生理結(jié)合狀態(tài),但存在靈敏度低、檢測(cè)成本高等固有不足。

      與這些主要聚焦于“靶標(biāo)識(shí)別與鑒定”的傳統(tǒng)靶標(biāo)捕獲技術(shù)相比,PROTAC 靶標(biāo)捕獲技術(shù)作為一種先進(jìn)的靶標(biāo)解析工具,可避免對(duì)天然產(chǎn)物進(jìn)行化學(xué)修飾,并能在活細(xì)胞生理?xiàng)l件下進(jìn)行原位靶標(biāo)捕獲,從而克服傳統(tǒng)方法的局限。因此,該技術(shù)已越來(lái)越多地用于中藥成分和天然產(chǎn)物的靶標(biāo)鑒定,為該研究領(lǐng)域提供了新的高效策略。PROTAC 作為近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的強(qiáng)大內(nèi)源性蛋白降解工具,其核心優(yōu)勢(shì)不僅在于可特異性結(jié)合靶蛋白,還可通過(guò)泛素-蛋白酶體系統(tǒng)觸發(fā)靶蛋白泛素化及后續(xù)降解,從而進(jìn)一步提高靶標(biāo)鑒定的可靠性。

      茜草(Rubia cordifolia L.)的根或根莖是一種傳統(tǒng)中藥,在中國(guó)被廣泛用于治療關(guān)節(jié)炎、子宮出血和慢性肝病。Rubimaillin(Rub,又稱 Mollugin)是從茜草中提取的一種萘醌類化合物,在研究中顯示出抗腫瘤、抗炎和神經(jīng)保護(hù)等多種藥理活性。此外,有報(bào)道顯示 Rub 可抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖并驅(qū)動(dòng)鐵死亡。然而,Rub 在肝纖維化中的作用仍未得到充分闡明。鑒于 CPT1A 在 HSCs 活化及其鐵死亡抵抗中發(fā)揮核心作用,同時(shí)考慮到 Rub 調(diào)控鐵死亡的潛力,本研究假設(shè) Rub 可能通過(guò)靶向 HSCs 中的 CPT1A 并誘導(dǎo)其鐵死亡,從而發(fā)揮抗肝纖維化作用。

      在本研究中,為評(píng)估 Rub 的抗肝纖維化作用,作者建立了轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子 β1(TGF-β1)誘導(dǎo)的 HSCs 活化模型和四氯化碳(CCl4)誘導(dǎo)的肝纖維化模型。隨后,研究者通過(guò) RNA 測(cè)序(RNA-seq)分析探索潛在機(jī)制,并通過(guò)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)證實(shí) Rub 可誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡。PROTAC、分子對(duì)接和結(jié)合實(shí)驗(yàn)鑒定并驗(yàn)證了 Rub 與 CPT1A 的相互作用。CPT1A 敲低和過(guò)表達(dá)模型進(jìn)一步驗(yàn)證了 Rub 誘導(dǎo)鐵死亡對(duì) CPT1A 的依賴性。最后,研究者分析了 Rub 對(duì) NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路的調(diào)控,以闡明其通過(guò)靶向 CPT1A 誘導(dǎo)鐵死亡的機(jī)制。

      02

      重要發(fā)現(xiàn)及亮點(diǎn)

      Rub 在體外抑制 HSCs 活化

      為評(píng)價(jià) Rub 在體外對(duì) HSCs 活化的抑制作用,研究者采用 TGF-β1 誘導(dǎo)人 HSCs 細(xì)胞系 LX2 和小鼠 HSCs 細(xì)胞系 JS1 的活化。在評(píng)價(jià) HSCs 活化之前,首先通過(guò) CCK8 實(shí)驗(yàn)檢測(cè) Rub 對(duì) LX2 和 JS1 細(xì)胞活力的影響。LX2 和 JS1 細(xì)胞在有或無(wú) TGF-β1 誘導(dǎo)的條件下,同時(shí)接受不同濃度 Rub 處理 48 小時(shí)。如圖 1A 所示,在 25–300 μM 范圍內(nèi),Rub 對(duì) LX2 和 JS1 細(xì)胞活力表現(xiàn)出不同程度的濃度依賴性抑制作用。顯然,Rub 對(duì) TGF-β1 誘導(dǎo)細(xì)胞的活力抑制作用更為顯著。

      進(jìn)一步分析細(xì)胞活力抑制率發(fā)現(xiàn),Rub 對(duì) TGF-β1 刺激的 LX2 和 JS1 細(xì)胞抑制率超過(guò) 20%(范圍:20.94%–31.63%),而對(duì)未受 TGF-β1 刺激的 LX2 和 JS1 細(xì)胞抑制率低于 20%(范圍:2.70%–16.68%),且兩種細(xì)胞系中 TGF-β1 刺激組與未刺激組之間差異均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(圖 1B)。因此,在 50、100 和 150 μM 濃度下,Rub 不會(huì)改變靜息 HSCs 的細(xì)胞活力。

      隨后,研究者在 50、100 和 150 μM 濃度下評(píng)價(jià) Rub 對(duì) HSCs 活化的抑制作用。LX2 和 JS1 細(xì)胞經(jīng) TGF-β1 誘導(dǎo)活化并與 Rub 共孵育后,采用 qPCR 和 Western blot 檢測(cè) HSCs 活化標(biāo)志物 α-SMA 和 Col1A1。結(jié)果顯示,Rub 可顯著降低 LX2 和 JS1 細(xì)胞中 α-SMA 與 Col1A1 的 mRNA 表達(dá),以及 α-SMA 蛋白表達(dá),并呈濃度依賴性抑制(圖 1C-D)。此外,研究者還通過(guò)免疫熒光檢測(cè) α-SMA 和 Col1A1 的表達(dá),結(jié)果顯示,在 TGF-β1 誘導(dǎo)的 LX2 和 JS1 細(xì)胞中,α-SMA 和 Col1A1 陽(yáng)性染色熒光強(qiáng)度顯著增強(qiáng);而不同濃度 Rub 孵育可明顯抑制該熒光增強(qiáng)(圖 1E-F)。綜上,這些結(jié)果證實(shí) Rub 是一種潛在抑制劑,可顯著抑制 HSCs 活化。


      圖 1. Rub對(duì) LX2 和 JS1 細(xì)胞中 HSCs 活化的影響。(A)Rub 對(duì) LX2 和 JS1 細(xì)胞活力的影響。(B)Rub 對(duì) LX2 和 JS1 細(xì)胞活力的抑制率。(C)LX2 和 JS1 細(xì)胞中 α-SMA 和 Col1A1 的 mRNA 表達(dá)。(D)LX2 和 JS1 細(xì)胞中 α-SMA 的蛋白表達(dá)。(E)LX2 和 JS1 細(xì)胞中 α-SMA(綠色,比例尺 = 100 μm)和 Col1A1(紅色,比例尺 = 100 μm)的免疫熒光染色。(F)LX2 和 JS1 細(xì)胞中 α-SMA 和 Col1A1 陽(yáng)性染色的熒光強(qiáng)度。所有實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行 n = 3 次獨(dú)立生物學(xué)重復(fù)。 < 0.05 vs DMSO;*p < 0.05 vs TGF-β1。

      Rub 有效改善 CCl4 誘導(dǎo)小鼠的肝損傷和肝纖維化

      為考察 Rub 對(duì)肝損傷和肝纖維化的藥理作用,研究者通過(guò)每周 3 次腹腔注射 15% CCl4、持續(xù) 6 周建立小鼠肝纖維化模型,并從第 3 周開(kāi)始給予 Rub(10 和 20 mg/kg)灌胃處理(圖 2A)。實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,依次評(píng)價(jià)小鼠肝損傷和肝纖維化指標(biāo)。CCl4 組中升高的血清肝損傷標(biāo)志物(如 AST 和 ALT 水平)經(jīng) Rub 處理后顯著降低(圖 2B)。

      同時(shí),肝組織病理學(xué) H&E 染色結(jié)果如圖 2C 所示。與對(duì)照組相比,CCl4 誘導(dǎo)肝纖維化小鼠的肝組織出現(xiàn)明顯組織學(xué)改變,包括正常肝小葉結(jié)構(gòu)被破壞、肝細(xì)胞腫脹并出現(xiàn)空泡樣變性、肝竇間隙變窄、纖維間隔增寬以及肝組織中明顯炎性細(xì)胞浸潤(rùn)。然而,這些病理改變可被 Rub 處理顯著改善。

      此外,研究者采用 Masson 染色和 Sirius red 染色評(píng)價(jià)膠原纖維沉積。在 CCl4 誘導(dǎo)的肝纖維化小鼠中,膠原沉積明顯,纖維間隔染色強(qiáng)烈,呈增厚和廣泛分布;同時(shí),Masson 陽(yáng)性面積和 Sirius red 陽(yáng)性面積均顯著升高。Rub 處理后,纖維化小鼠膠原纖維沉積明顯減輕(圖 2D 和 F)。與此同時(shí),作為膠原代謝重要指標(biāo)的肝羥脯氨酸(Hyp)含量也被檢測(cè),結(jié)果顯示 Rub 處理后 Hyp 含量明顯下降(圖 2G)。

      HSCs 活化常用于評(píng)價(jià)體內(nèi)肝纖維化的發(fā)生與發(fā)展。因此,本研究也像體外實(shí)驗(yàn)一樣,通過(guò) qPCR、Western blot 和免疫組織化學(xué)檢測(cè) HSCs 活化相關(guān)指標(biāo)。結(jié)果見(jiàn)圖 2E 和 H:免疫組織化學(xué)結(jié)果顯示,CCl4 組 α-SMA 陽(yáng)性染色明顯增加,而 Rub 組顯著降低。qPCR 和 Western blot 結(jié)果顯示,CCl4 誘導(dǎo)小鼠肝組織中升高的 α-SMA 和 Col1A1 mRNA 表達(dá),以及 α-SMA 蛋白表達(dá),均被 Rub 處理顯著降低(圖 2I-J)。此外,CCl4 組中部分纖維化相關(guān)基因 Col1A3 和 TGF-β1 的 mRNA 表達(dá)也經(jīng) Rub 處理顯著降低(圖 2I)。這些結(jié)果提示,Rub 可抑制 CCl4 誘導(dǎo)小鼠中的 HSCs 活化。值得注意的是,在所有檢測(cè)參數(shù)中,Rub 的治療效果與陽(yáng)性對(duì)照藥物索拉非尼(Sora)相當(dāng),甚至更優(yōu)。總體而言,這些數(shù)據(jù)表明 Rub 可有效改善 CCl4 誘導(dǎo)小鼠的肝損傷和肝纖維化。


      圖 2. Rub 對(duì) CCl4 誘導(dǎo)小鼠肝損傷和肝纖維化的影響。(A)CCl4 注射并接受 Rub 或 Sora 治療小鼠的實(shí)驗(yàn)流程示意圖。(B)血清 ALT 和 AST 活性。(C)H&E 染色(比例尺 = 100 μm 和 50 μm)。(D、F)Masson 和 Sirius red 染色(比例尺 = 100 μm)及其半定量分析。(E、H)α-SMA 免疫組織化學(xué)染色(黃褐色,比例尺 = 100 μm)及其半定量分析。(G)肝臟 Hyp 含量。(I)α-SMA、Col1A1、Col3A1 和 TGF-β1 的 mRNA 表達(dá)。(J)α-SMA 的蛋白表達(dá)。n = 6, < 0.05 vs Control;*p < 0.05 vs CCl4。

      RNA-seq 分析顯示 Rub 調(diào)控鐵死亡通路

      為探索 Rub 抗肝纖維化作用的分子機(jī)制,研究者對(duì)經(jīng) Rub 處理或未處理的纖維化肝組織進(jìn)行 RNA-seq 分析。差異表達(dá)基因火山圖分析顯示,Rub-vs-CCl4 組的基因表達(dá)譜發(fā)生整體變化,共富集到 722 個(gè)下調(diào)基因和 1034 個(gè)上調(diào)基因(圖 3A)。在 KEGG 通路分析中,谷胱甘肽代謝和鐵死亡通路顯著富集(圖 3B)。

      進(jìn)一步采用基因集富集分析(GSEA)對(duì)這兩個(gè)通路進(jìn)行分析,其 NES、P 值和 FDR 分別為:谷胱甘肽代謝(NES = -2.52,p < 0.001,F(xiàn)DR < 0.001)和鐵死亡(NES = -2.28,P < 0.001,F(xiàn)DR = 0.0)(圖 3C),提示這兩個(gè)通路在 GSEA 中同樣顯著富集。谷氨酸代謝參與鐵死亡并與該過(guò)程密切相關(guān)。鐵死亡通路差異表達(dá)基因熱圖如圖 3D 所示;例如,經(jīng) Rub 處理后,Hmox1、Slc7a11 和 Gclc 表達(dá)顯著降低,而 Acsl3、Acsl4 和 Acsl5 表達(dá)顯著升高。綜上,Rub 可在肝纖維化中顯著誘導(dǎo)鐵死亡,這可能是 Rub 抗肝纖維化作用的潛在分子機(jī)制。


      圖 3. 基于 RNA-seq 分析的 Rub 對(duì)鐵死亡通路的影響。(A)火山圖顯示 mRNA 轉(zhuǎn)錄水平的 log2 倍數(shù)變化。(B)KEGG 通路富集分析(前 20 位)。(C)谷胱甘肽代謝和鐵死亡通路的 GSEA 分析。(D)基于 GSEA 分析的鐵死亡通路相關(guān)基因表達(dá)譜熱圖。

      Rub 誘導(dǎo)活化 HSCs 發(fā)生鐵死亡

      為確定 Rub 誘導(dǎo)鐵死亡發(fā)生于哪一類肝細(xì)胞,研究者評(píng)價(jià)了 Rub 對(duì) HSCs、巨噬細(xì)胞、肝竇內(nèi)皮細(xì)胞和肝細(xì)胞鐵死亡的影響。考慮到 HSCs 是介導(dǎo)肝纖維化的關(guān)鍵效應(yīng)細(xì)胞,且越來(lái)越多證據(jù)表明誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡是治療肝纖維化的有效措施,研究者首先評(píng)價(jià) Rub 是否可誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡。在本研究中,在 Rub 處理的 CCl4 誘導(dǎo)小鼠中觀察到活化 HSCs 的 Rub 誘導(dǎo)鐵死亡。具體而言,免疫熒光染色結(jié)果顯示,在 Rub 處理的纖維化小鼠中,鐵死亡過(guò)程正向調(diào)控因子 ACSL4 與活化 HSCs 標(biāo)志物 α-SMA 的共染顯著上調(diào)(圖 4A 和 B)。

      隨后,研究者開(kāi)展一系列實(shí)驗(yàn),在體外評(píng)價(jià) Rub 對(duì)活化 HSCs 鐵死亡的影響。首先,將 TGF-β1 誘導(dǎo)的 LX2 和 JS1 細(xì)胞與 Rub 及 Fer-1(一種鐵死亡抑制劑)共同孵育,結(jié)果顯示 Fer-1 可消除 Rub 對(duì)細(xì)胞活力的抑制作用(補(bǔ)充材料圖 S1A)。已有研究證實(shí),在鐵死亡過(guò)程中,細(xì)胞線粒體的形態(tài)學(xué)變化表現(xiàn)為線粒體體積減小、雙層膜密度增加以及線粒體嵴減少或消失。結(jié)果如圖 4C 和補(bǔ)充材料圖 S1B 所示,在 Rub 處理的活化 LX2 和 JS1 細(xì)胞中觀察到與鐵死亡相關(guān)的線粒體形態(tài)改變。

      與此同時(shí),Rub 處理的活化 LX2 和 JS1 細(xì)胞中也出現(xiàn)了其他重要鐵死亡指標(biāo)的變化,表現(xiàn)為 GSH 含量下降,GSSG、LPO、ROS 和 Fe2+ 水平升高(圖 4D-E 和補(bǔ)充材料圖 S1C-D)。此外,Rub 處理可顯著下調(diào) GPX4 蛋白水平,并顯著上調(diào) ACSL4 蛋白水平(補(bǔ)充材料圖 S1E)。研究者還評(píng)價(jià)了 Rub 對(duì) HSCs 凋亡或壞死(兩種最常見(jiàn)的替代性細(xì)胞死亡方式)的影響,結(jié)果顯示 Rub 并未顯著調(diào)控 HSCs 的這兩類細(xì)胞死亡(補(bǔ)充材料圖 S2)。這些結(jié)果提示 Rub 可誘導(dǎo) HSCs 發(fā)生鐵死亡。

      根據(jù)鐵死亡關(guān)鍵指標(biāo) ACSL4 的免疫熒光結(jié)果可知,在肝纖維化中,Rub 主要調(diào)控纖維間隔間質(zhì)細(xì)胞中這些蛋白的表達(dá),提示 Rub 誘導(dǎo)的肝細(xì)胞鐵死亡主要發(fā)生于間質(zhì)細(xì)胞。因此,研究者進(jìn)一步評(píng)價(jià) Rub 對(duì)巨噬細(xì)胞和肝竇內(nèi)皮細(xì)胞鐵死亡的影響。結(jié)果顯示,Rub 處理組中 ACSL4 與 CD11b(肝 Kupffer 細(xì)胞標(biāo)志物)和 CD34(肝竇內(nèi)皮細(xì)胞標(biāo)志物)的免疫熒光共染極少,與 CCl4 模型組相比無(wú)顯著差異(補(bǔ)充材料圖 S3A-B)。此外,研究者還在體外評(píng)價(jià) Rub 對(duì)肝細(xì)胞鐵死亡的影響,結(jié)果顯示 Rub 不會(huì)促進(jìn)肝細(xì)胞系 AML12 細(xì)胞發(fā)生鐵死亡(補(bǔ)充材料圖 S4)。綜上,上述結(jié)果證實(shí),在肝纖維化中 Rub 可誘導(dǎo)活化 HSCs 發(fā)生鐵死亡。


      圖 4. Rub 對(duì)活化 HSCs 鐵死亡的影響。(A)CCl4 誘導(dǎo)小鼠肝切片中 ACSL4(綠色)和 α-SMA(紅色)的免疫熒光共染(比例尺 = 100 μm)。(B)ACSL4 和 α-SMA 共染的半定量分析。(C)TGF-β1 誘導(dǎo)的 LX2 細(xì)胞線粒體超微結(jié)構(gòu)變化(比例尺 = 200 nm)。(D、E)TGF-β1 誘導(dǎo)的 LX2 細(xì)胞中 LPO、ROS 和 Fe2+ 的熒光染色(比例尺 = 100 μm)。所有實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行 n = 3 次獨(dú)立生物學(xué)重復(fù)。 < 0.05 vs Control;*p < 0.05 vs CCl4 或 TGF-β1。


      CPT1A 是 Rub-PROTAC 的降解靶標(biāo)

      為研究 Rub 在抗肝纖維化中的靶點(diǎn),研究者采用 PROTAC 靶標(biāo)捕獲技術(shù)在 LX2 細(xì)胞中鑒定其靶標(biāo)。首先,選擇 Rub 合成 PROTAC 分子。為合成 Rub 的 PROTAC,研究者選取活性最強(qiáng)的 Rub 核心骨架結(jié)構(gòu)作為目標(biāo)蛋白(POI)配體,并將 Rub 與連接至沙利度胺的 1-聚乙二醇(1-PEG)連接子偶聯(lián),獲得 PROTAC 分子(稱為 Rub-PROTAC)(圖 5A 和補(bǔ)充材料方案 S1)。與此同時(shí),Rub-PROTAC 對(duì) TGF-β1 刺激 LX2 細(xì)胞中 α-SMA 蛋白表達(dá)也表現(xiàn)出顯著抑制活性(圖 5B)。

      為研究直接而非間接蛋白降解,LX2 細(xì)胞僅用 Rub-PROTAC 和 DMSO 處理 10 小時(shí);隨后采用 4D-DIA 蛋白質(zhì)組學(xué)分析 Rub-PROTAC 顯著降解的蛋白(圖 5C)。如圖 5D 和 E 所示,一些蛋白顯著下調(diào),如 ZC3H11A、CPT1A、PDCD11、ABCF3 和 COPB2。在這些蛋白中,已有研究報(bào)道 CPT1A 對(duì)肝纖維化發(fā)展和鐵死亡過(guò)程至關(guān)重要。在肝纖維化中,CPT1A 缺失可緩解 HSCs 活化和肝纖維化。此外,已有研究表明 CPT1A 缺乏可誘導(dǎo)肺癌細(xì)胞發(fā)生鐵死亡。結(jié)合分析結(jié)果與 Rub 的藥理作用,研究者最終將研究重點(diǎn)集中于 CPT1A。

      為驗(yàn)證蛋白質(zhì)組學(xué)分析結(jié)果,研究者將 LX2 和 JS1 細(xì)胞與不同濃度 Rub-PROTAC 共孵育 10 小時(shí)。結(jié)果顯示,Rub-PROTAC 以濃度依賴性方式增強(qiáng) CPT1A 泛素化(Ub-CPT1A),并以濃度依賴性方式降解 CPT1A 蛋白(圖 5F)。隨后,研究者將經(jīng) Rub-PROTAC 處理的細(xì)胞與泛素化抑制劑 MG132 共孵育,結(jié)果顯示 MG132 可消除 Rub-PROTAC 介導(dǎo)的 Ub-CPT1A 增強(qiáng)和 CPT1A 蛋白降解(圖 5G)。進(jìn)一步地,研究者在 LX2 和 JS1 細(xì)胞中同時(shí)共孵育 Rub 和 Rub-PROTAC,以評(píng)價(jià)是否存在對(duì) CPT1A 的競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合。結(jié)果顯示,Rub 可部分逆轉(zhuǎn) Rub-PROTAC 對(duì) CPT1A 蛋白的降解作用(圖 5H)。總之,上述結(jié)果證實(shí) Rub-PROTAC 通過(guò)泛素化通路降解 CPT1A 蛋白,且 CPT1A 可能是 Rub 的結(jié)合靶標(biāo)。


      圖 5. 利用 PROTAC 技術(shù)在 LX2 細(xì)胞中分析并確定 Rub 靶蛋白。(A)Rub 探針與 PROTAC 分子(Rub-PROTAC)的合成。(B)Rub 和 Rub-PROTAC 處理 LX2 細(xì)胞后 α-SMA 的蛋白表達(dá)。(C)基于 4D-DIA 蛋白質(zhì)組學(xué)分析的靶標(biāo)鑒定流程。(D)差異蛋白火山圖。(E)log2FoldChange < -1 的降解蛋白。(F)Rub-PROTAC 處理 LX2 和 JS1 細(xì)胞中 CPT1A 蛋白的濃度依賴性泛素化與降解。(G)MG132 和 Rub-PROTAC 處理 LX2 和 JS1 細(xì)胞中 CPT1A 蛋白的泛素化與降解。(H)Rub-PROTAC 與 Rub 共處理 LX2 和 JS1 細(xì)胞 10 小時(shí)后 CPT1A 的蛋白水平。所有實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行 n = 3 次獨(dú)立生物學(xué)重復(fù)。 < 0.05 vs DMSO;*p < 0.05 vs TGF-β1 或 Rub-PROTAC。

      Rub 在 HSCs 中直接靶向 CPT1A

      為確認(rèn) CPT1A 是 Rub 的直接靶點(diǎn),研究者首先選擇 CPT1A-Rub 復(fù)合物和 CPT1A 進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬,以評(píng)價(jià) Rub 與 CPT1A 的結(jié)合。在整個(gè)模擬過(guò)程中(200 ns),CPT1A 的 Cα 主鏈均方根偏差(RMSD)基本穩(wěn)定在 3 ?,說(shuō)明該系統(tǒng)在模擬過(guò)程中達(dá)到平衡狀態(tài)。CPT1A-Rub 復(fù)合物的 Cα 主鏈 RMSD 從模擬初期升至 6 ?,隨后在模擬中期降至 5 ?,并在模擬后期穩(wěn)定維持在 5 ? 以下,提示該結(jié)合構(gòu)象具有較高熱力學(xué)穩(wěn)定性(圖 6A)。

      從均方根波動(dòng)(RMSF)結(jié)果可見(jiàn),CPT1A 活性位點(diǎn)氨基酸殘基的 RMSF 基本低于 2.0–2.5 ?,提示 CPT1A-Rub 的配體結(jié)合可穩(wěn)定活性位點(diǎn)的局部構(gòu)象(圖 6B)。同時(shí),研究者還監(jiān)測(cè)了 CPT1A-Rub 系統(tǒng)中的氫鍵數(shù)量、旋轉(zhuǎn)半徑(Rg)和溶劑可及表面積(SASA)變化(圖 6C-E)。這些結(jié)果進(jìn)一步表明,Rub 在整個(gè)模擬過(guò)程中可穩(wěn)定結(jié)合 CPT1A;CPT1A-Rub 的氫鍵數(shù)量保持穩(wěn)定,且氫鍵結(jié)合位點(diǎn)也一致。此外,自由能景觀(FEL)分析顯示,PC1(20)/PC2(-20) 是一個(gè)低能量凹陷,提示此時(shí) Rub 和 CPT1A 的構(gòu)象穩(wěn)定(圖 6F)。這些數(shù)據(jù)表明 Rub 可在整個(gè)模擬過(guò)程中穩(wěn)定結(jié)合 CPT1A。

      隨后,研究者分別采用細(xì)胞熱轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)(CETSA)、藥物親和反應(yīng)靶標(biāo)穩(wěn)定性(DARTS)實(shí)驗(yàn)和生物層干涉(BLI)實(shí)驗(yàn)評(píng)價(jià) Rub 與 CPT1A 的結(jié)合能力。在 CETSA 實(shí)驗(yàn)中,Rub 明顯提高 LX2 和 JS1 細(xì)胞中 CPT1A 蛋白的細(xì)胞熱穩(wěn)定性(圖 6G)。在 DARTS 實(shí)驗(yàn)中,Rub 孵育后 LX2 和 JS1 細(xì)胞中 CPT1A 的降解顯著減少(圖 6H)。在 BLI 實(shí)驗(yàn)中,Rub 與 CPT1A 的平衡解離常數(shù)(KD)為 3.77E-04 mol/L(圖 6I)。此外,研究者評(píng)價(jià)了 Rub 對(duì) CPT1A 活性的影響,發(fā)現(xiàn) Rub 可顯著抑制 LX2 和 JS1 細(xì)胞中的 CPT1A 活性(圖 6J 和補(bǔ)充材料圖 S5A)。

      進(jìn)一步地,研究者進(jìn)行分子對(duì)接模擬以研究 Rub-CPT1A 復(fù)合物的結(jié)合模式。結(jié)果顯示,Rub 可能與 CPT1A 的 SER592、THR594 和 THR689 形成氫鍵網(wǎng)絡(luò)(圖 6K)。最后,在 shRNA 介導(dǎo)內(nèi)源性 CPT1A 敲低的 LX2 細(xì)胞中,將 SER592、THR594 和 THR689 系統(tǒng)性突變?yōu)楸彼幔㈦S后過(guò)表達(dá)野生型 CPT1A。結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些位點(diǎn)突變顯著削弱了 Rub 對(duì) CPT1A 活性的抑制作用,提示 SER592、THR594 和 THR689 是 Rub 抑制 CPT1A 活性的關(guān)鍵結(jié)合位點(diǎn)(圖 6L)。

      為評(píng)價(jià) Rub 相較其他肝細(xì)胞類型對(duì) HSCs 的特異性,研究者在 150 μM 濃度下檢測(cè) Rub 對(duì) TGF-β1 活化 LX2 細(xì)胞、正常小鼠肝細(xì)胞(AML12)、LPS 極化小鼠骨髓來(lái)源巨噬細(xì)胞(iBMDM)以及 VEGF 刺激的人肝竇內(nèi)皮細(xì)胞(HHSEC)中 CPT1A 活性的影響,并比較不同細(xì)胞間的活性抑制率。結(jié)果顯示,Rub 在 LX2 細(xì)胞中對(duì) CPT1A 活性的抑制效率顯著高于 AML12、iBMDM 和 HHSEC 細(xì)胞(補(bǔ)充材料圖 S5B-C)。同時(shí),研究者檢測(cè)了 Rub 處理后肝組織中 CPT1A 的表達(dá),結(jié)果顯示 Rub 可顯著降低 CCl4 誘導(dǎo)肝纖維化中的 CPT1A 蛋白水平(補(bǔ)充圖 S5D)。綜上,這些結(jié)果提示 CPT1A 是 Rub 在 HSCs 中的直接藥理靶點(diǎn)。


      圖 6. Rub 直接靶向 CPT1A 的驗(yàn)證。(A)采用均方根偏差(RMSD)評(píng)價(jià) Rub-CPT1A 結(jié)合穩(wěn)定性。(B)均方根波動(dòng)(RMSF)。(C)模擬過(guò)程中的氫鍵數(shù)量。(D)旋轉(zhuǎn)半徑(Rg)。(E)溶劑可及表面積(SASA)。(F)自由能景觀(FEL)分析。(G、H)采用 CETSA 和 DARTS 實(shí)驗(yàn)檢測(cè) LX2 和 JS1 細(xì)胞中 CPT1A 的蛋白水平。(I)BLI 實(shí)驗(yàn)中 Rub 與 CPT1A 的結(jié)合動(dòng)力學(xué)。(J)Rub 對(duì) LX2 細(xì)胞中 CPT1A 活性的影響。(K)Rub 與 CPT1A 之間的分子對(duì)接模擬。(L)位點(diǎn)突變 LX2 細(xì)胞中 Rub 對(duì) CPT1A 活性的影響。所有實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行 n = 3 次獨(dú)立生物學(xué)重復(fù)。 < 0.05 vs Ctr 或 DMSO;*p < 0.05 vs TGF-β1 或 Rub-PROTAC。

      Rub 通過(guò)靶向 CPT1A 誘導(dǎo)活化 LX2 細(xì)胞發(fā)生鐵死亡

      基于此前關(guān)于 CPT1A 缺失可在肝纖維化過(guò)程中緩解 HSCs 活化,并可在腫瘤細(xì)胞中誘導(dǎo)鐵死亡的報(bào)道,研究者推測(cè) CPT1A 同樣在誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡中發(fā)揮作用。為驗(yàn)證這一假設(shè),研究者進(jìn)行了 CPT1A 活性抑制劑 Etomoxir 處理和 CPT1A 敲低實(shí)驗(yàn),以探討 CPT1A 在 TGF-β1 誘導(dǎo) LX2 細(xì)胞中誘導(dǎo)鐵死亡的作用。首先,LX2 細(xì)胞用不同濃度 Etomoxir 培養(yǎng) 48 小時(shí);結(jié)果顯示,在無(wú) TGF-β1 刺激的 LX2 細(xì)胞中,Etomoxir 對(duì)細(xì)胞活力無(wú)抑制作用,但在 50 和 100 μM 濃度下對(duì) TGF-β1 刺激的 LX2 細(xì)胞活力具有顯著抑制作用,尤其在 100 μM 時(shí),細(xì)胞活力低于 80%(補(bǔ)充圖 S6A)。然而,F(xiàn)er-1 可消除 Etomoxir 介導(dǎo)的 LX2 細(xì)胞生長(zhǎng)抑制(補(bǔ)充圖 S6B)。

      隨后,研究者觀察到明顯的鐵死亡線粒體形態(tài)學(xué)改變;在 TGF-β1 刺激的 Etomoxir 處理 LX2 細(xì)胞中,NADPH 和 GSH 含量顯著下降,GSSG、LPO、ROS 和 Fe2+ 水平顯著升高(補(bǔ)充圖 S6C-E)。此外,在 TGF-β1 誘導(dǎo)的 Etomoxir 處理 LX2 細(xì)胞中,ACSL4 蛋白表達(dá)顯著升高,而 GPX4 蛋白表達(dá)顯著降低(補(bǔ)充圖 S6F)。如預(yù)期,在 TGF-β1 誘導(dǎo)的 LX2 細(xì)胞中,CPT1A 敲低結(jié)果與 Etomoxir 處理結(jié)果一致(補(bǔ)充圖 S6C-F)。

      此外,磷脂是構(gòu)成細(xì)胞膜脂質(zhì)雙層的基本成分,可根據(jù)其頭基分為磷脂酰膽堿(PC)、磷脂酰乙醇胺(PE)、磷脂酰絲氨酸(PS)、磷脂酰肌醇(PI)和磷脂酸(PA)。PL-PUFAs 是脂質(zhì)過(guò)氧化的主要底物,由 ACSL4 生成,被認(rèn)為是鐵死亡的驅(qū)動(dòng)因素。因此,研究者進(jìn)行了非靶向脂質(zhì)組學(xué)以分析 PL-PUFAs 的代謝狀態(tài)。結(jié)果顯示,在轉(zhuǎn)染 shCPT1A 的 LX2 細(xì)胞中,PL-PUFAs 水平升高,尤其是 PC-PUFAs、PE-PUFAs 和 PI-PUFAs(補(bǔ)充圖 S6G)。總之,這些數(shù)據(jù)提示阻斷 CPT1A 可誘導(dǎo)由代謝重編程介導(dǎo)的活化 HSCs 鐵死亡。

      為驗(yàn)證 Rub 誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡是否由靶向 CPT1A 介導(dǎo),研究者進(jìn)行 CPT1A 敲低實(shí)驗(yàn),以探索 CPT1A 在 TGF-β1 誘導(dǎo) LX2 細(xì)胞中 Rub 誘導(dǎo)鐵死亡中的作用。如圖 7A-E 所示,在 TGF-β1 刺激的 LX2 細(xì)胞中,Rub 可明顯誘導(dǎo)鐵死亡線粒體形態(tài)變化,顯著降低 NADPH 和 GSH 含量,升高 GSSG、LPO、ROS、Fe2+ 和 PL-PUFAs 水平,同時(shí)增加 ACSL4 蛋白表達(dá)并抑制 GPX4 蛋白水平。隨后,研究者將靶向 CPT1A 的 shRNA 轉(zhuǎn)染入 TGF-β1 誘導(dǎo)的 LX2 細(xì)胞,再進(jìn)行 Rub 孵育。結(jié)果顯示,加入 shCPT1A 后,Rub 誘導(dǎo)鐵死亡的顯著變化被明顯消除(圖 7A-F)。換言之,Rub 未能進(jìn)一步加重 shCPT1A 轉(zhuǎn)染 LX2 細(xì)胞中的鐵死亡。

      此外,研究者還評(píng)價(jià)了 CPT1A 過(guò)表達(dá)對(duì) Rub 誘導(dǎo)鐵死亡的影響。與 CPT1A 敲低結(jié)果類似,CPT1A 過(guò)表達(dá)同樣消除了 Rub 在 LX2 細(xì)胞中誘導(dǎo)鐵死亡的作用(補(bǔ)充材料圖 S7A-D)。這些數(shù)據(jù)表明,CPT1A 敲低和 CPT1A 過(guò)表達(dá)均可消除 Rub 誘導(dǎo) HSCs 鐵死亡的作用。綜上,這些結(jié)果證明 Rub 的鐵死亡誘導(dǎo)效應(yīng)依賴于 CPT1A 介導(dǎo)的代謝重編程。


      圖 7. CPT1A 缺失對(duì) Rub 誘導(dǎo) TGF-β1 誘導(dǎo) LX2 細(xì)胞鐵死亡的影響。(A)LX2 細(xì)胞中 NADPH、GSH 和 GSSG 水平。(B、C)LX2 細(xì)胞線粒體超微結(jié)構(gòu)變化(比例尺 = 200 μm)、LPO、ROS 和 Fe2+ 的熒光染色(比例尺 = 100 μm)。(D)LX2 細(xì)胞中 GPX4 和 ACSL4 的蛋白表達(dá)。(E、F)LX2 細(xì)胞中 PL-PUFAs 水平變化。所有實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行 n = 3 次獨(dú)立生物學(xué)重復(fù)。*p < 0.05 vs shNC。

      Rub 通過(guò)靶向 CPT1A 調(diào)控 c-Myc 泛素化介導(dǎo)的 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路

      接下來(lái),研究者繼續(xù)探索 Rub 如何通過(guò) CPT1A 在 HSCs 中誘導(dǎo)鐵死亡。已有報(bào)道顯示,靶向 CPT1A 可通過(guò)抑制 c-Myc 泛素化,調(diào)控 NRF2/GPX4 抗氧化系統(tǒng)和 ACSL4/PL-PUFAs 通路,從而介導(dǎo)代謝重塑并誘導(dǎo)肺癌干細(xì)胞鐵死亡。結(jié)合本研究上述結(jié)果,作者假設(shè) Rub 誘導(dǎo)鐵死亡與活化 HSCs 中 CPT1A 泛素化介導(dǎo)的 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路密切相關(guān)。因此,研究者評(píng)價(jià)了 Rub 對(duì)這些通路的影響。

      Western blot 結(jié)果顯示,Rub 處理的 TGF-β1 誘導(dǎo) LX2 細(xì)胞中 GPX4 和核 NRF2 蛋白水平降低,而 c-Myc 泛素化(Ub-c-Myc)、胞質(zhì) NRF2 和 ACSL4 蛋白水平升高(圖 8A),并伴隨 PL-PUFAs 水平升高(圖 7E)。隨后,研究者將靶向 CPT1A 的 shRNA 轉(zhuǎn)染入 TGF-β1 誘導(dǎo)的 LX2 細(xì)胞,以進(jìn)一步研究 CPT1A 在 Rub 調(diào)控 c-Myc 泛素化以及 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路中的作用。Western blot 結(jié)果顯示,靶向 CPT1A 的 shRNA 顯著消除了 Rub 在 TGF-β1 誘導(dǎo) LX2 細(xì)胞中調(diào)控 c-Myc 泛素化以及 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路的能力(圖 7E、圖 8C 和 D)。總之,研究結(jié)果證實(shí),Rub 可通過(guò)促進(jìn) CPT1A 介導(dǎo)的 c-Myc 泛素化,并調(diào)控 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路,在活化 HSCs 中誘導(dǎo)由代謝重編程介導(dǎo)的鐵死亡(圖 9)。


      圖 8. Rub 對(duì) LX2 細(xì)胞中 c-Myc 泛素化介導(dǎo)的 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路的影響。(A、B)Rub 和 Etomoxir 對(duì) LX2 細(xì)胞中 GPX4、ACSL4、核 NRF2、胞質(zhì) NRF2、c-Myc 泛素化和 c-Myc 蛋白水平的影響。(C、D)Rub 對(duì) LX2 細(xì)胞中 GPX4、ACSL4、核 NRF2、胞質(zhì) NRF2、Ub-c-Myc 和 c-Myc 蛋白水平的影響。所有實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行 n = 3 次獨(dú)立生物學(xué)重復(fù)。*p < 0.05 vs DMSO 或 shNC。


      圖 9. Rub 通過(guò)靶向 CPT1A,在活化 HSCs 中誘導(dǎo)代謝重編程介導(dǎo)的鐵死亡,從而改善肝纖維化。在肝纖維化過(guò)程中,活化 HSCs 中 CPT1A 升高,可通過(guò)增強(qiáng) NRF2/GPX4 通路介導(dǎo)的抗氧化能力,并抑制 ACSL4 介導(dǎo)的 PL-PUFAs 生成,阻止活化 HSCs 發(fā)生鐵死亡。經(jīng) Rub 處理后,Rub 可通過(guò)靶向 CPT1A,在活化 HSCs 中誘導(dǎo)由代謝重編程介導(dǎo)的鐵死亡,從而改善肝纖維化;這一過(guò)程與 c-Myc 泛素化介導(dǎo)的 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路調(diào)控密切相關(guān)。

      【Citation】:Zhang, D., Tang, Q., He, X., Wen, C., Zhou, F., Wei, X., Wang, Z., Wang, J., Liu, W., Xu, Y., Jiang, Y., & Yin, H. (2026). Rubimaillin ameliorates liver fibrosis by triggering the ferroptosis of activated hepatic stellate cells through targeting CPT1A.International journal of biological sciences, 22(4), 2065–2084.

      貢獻(xiàn)★★★★★

      綜上,在本研究中,作者討論并證明 Rub 可在體內(nèi)和體外通過(guò)誘導(dǎo)代謝重編程介導(dǎo)的活化 HSCs 鐵死亡,從而有效改善肝纖維化。研究者利用 PROTAC 靶標(biāo)捕獲技術(shù)鑒定 CPT1A 為 Rub 的靶點(diǎn),并通過(guò)計(jì)算機(jī)分子動(dòng)力學(xué)模擬、CETSA、DARTS、BLI 和位點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證 Rub 可直接結(jié)合 CPT1A。

      此外,研究者不僅證明 CPT1A 是誘導(dǎo)活化 HSCs 鐵死亡的重要調(diào)控因子,也證實(shí)其是 Rub 誘導(dǎo)鐵死亡的關(guān)鍵靶點(diǎn)。進(jìn)一步結(jié)果顯示,Rub 通過(guò)靶向 CPT1A 在活化 HSCs 中誘導(dǎo)代謝重編程介導(dǎo)的鐵死亡,這可能與 c-Myc 泛素化介導(dǎo)的 NRF2/GPX4 和 ACSL4/PL-PUFAs 通路有關(guān)。然而,本研究也存在一定局限性,尤其是關(guān)于 Rub 通過(guò) CPT1A 介導(dǎo)對(duì) HSCs 的特異性靶向驗(yàn)證,仍需要利用體內(nèi) HSCs 特異性 CPT1A 敲除模型進(jìn)一步確認(rèn)。

      總之,Rub 可通過(guò)靶向 CPT1A 誘導(dǎo)代謝重編程介導(dǎo)的活化 HSCs 鐵死亡,從而改善肝纖維化,為肝纖維化治療提供了一種有前景的策略。

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